N4-乙酰胞苷测序(ac4C-seq)是另一种化学辅助测序方法,它使用硼氢化物将ac4C还原为N4-乙酰-3,4,5,6-四氢胞嘧啶,并通过对随后逆转录中由N4-乙酰-3,4,5,6-四氢胞嘧啶引起的突变位置以确定ac4C RNA位点。此外还有如PACES和机器学习模型XG-ac4C,用于预测mRNA中的ac4C位点。 表1:ac4C检测技术总结 基于高效液相色谱法(HPL
定量表观转录修饰 芯片特点 GST-YTH 法 数据库 实验流程 结果展示 Arraystar circRNA表观转录组芯片,可定量检测circRNA中m6A/m5C/m1A/ac4C/m7G/Ψ 的表观转录修饰水平。对于m6A修饰,我们提供了两种m6A- RNA富集方法可供选择:m6A抗体免疫沉淀(MeRIP)或GST-YTH pull down富集。
Arraystar mRNA&lncRNA表观转录组芯片,可定量检测mRNA&lncRNA中m6A/m5C/m1A/ac4C/m7G/Ψ的表观转录修饰水平。对于m6A修饰,我们提供了两种m6A- RNA富集方法可供选择:m6A抗体免疫沉淀(MeRIP)或GST-YTH pull down富集。 芯片优势 与MeRIP-seq相比,Arraystar表观转录组芯片有其独特的优势: • 可同时检测何种...
N4-乙酰胞苷测序(ac4C-seq)是另一种化学辅助测序方法,它使用硼氢化物将ac4C还原为N4-乙酰-3,4,5,6-四氢胞嘧啶,并通过对随后逆转录中由N4-乙酰-3,4,5,6-四氢胞嘧啶引起的突变位置以确定ac4C RNA位点。此外还有如PACES和机器学习模型XG-ac4C,用于预测mRNA中的ac4C位点。 表1:ac4C检测技术总结 基于高效液相...
N4-乙酰胞苷(ac4C)是一种高度保守的化学修饰,广泛存在于真核和原核生物RNA中,如tRNA、rRNA和mRNA。这种修饰与多种人类疾病显著相关,尤其是癌症,其形成主要依赖于N-乙酰转移酶10(NAT10)(唯一已知ac4C的writer蛋白)的催化活性。本文讨论了ac4C的检测技术及其调控机制,并总结了ac4C与肿瘤发生、发展、预后和药物治疗的...
N4-乙酰胞苷(ac4C)是一种高度保守的化学修饰,广泛存在于真核和原核生物RNA中,如tRNA、rRNA和mRNA。这种修饰与多种人类疾病显著相关,尤其是癌症,其形成主要依赖于N-乙酰转移酶10(NAT10)(唯一已知ac4C的writer蛋白)的催化活性。本文讨论了ac4C的检测技术及其调控机制,并总结了ac4C与肿瘤发生、发展、预后和药物治疗的...
基于抗体的方法使用靶向ac4C抗体来检测RNA序列中的ac4C,通过沉淀修饰过的RNA通过深度测序来鉴定。这些技术具有信号放大的优势,并已用于检测人类和病毒mRNA中的ac4C。2018年,Arango等人使用乙酰化RNA免疫沉淀测序(acRIP-seq)技术富集人类mRNA中的ac4C位点,这是首次在4000多个区域中鉴定出这些位点,并揭示其与翻译起始、mRNA...
N4-乙酰胞苷(ac4C)是一种高度保守的化学修饰,广泛存在于真核和原核生物RNA中,如tRNA、rRNA和mRNA。这种修饰与多种人类疾病显著相关,尤其是癌症,其形成主要依赖于N-乙酰转移酶10(NAT10)(唯一已知ac4C的writer蛋白)的催化活性。本文讨论了ac4C的检测技术及其调控机制,并总结了ac4C与肿瘤发生、发展、预后和药物治疗的...
基于抗体的方法使用靶向ac4C抗体来检测RNA序列中的ac4C,通过沉淀修饰过的RNA通过深度测序来鉴定。这些技术具有信号放大的优势,并已用于检测人类和病毒mRNA中的ac4C。2018年,Arango等人使用乙酰化RNA免疫沉淀测序(acRIP-seq)技术富集人类mRNA中的ac4C位点,这是首次在4000多个区域中鉴定出这些位点,并揭示其与翻译起始、mRNA...
N4-乙酰胞苷(ac4C)是一种高度保守的化学修饰,广泛存在于真核和原核生物RNA中,如tRNA、rRNA和mRNA。这种修饰与多种人类疾病显著相关,尤其是癌症,其形成主要依赖于N-乙酰转移酶10(NAT10)(唯一已知ac4C的writer蛋白)的催化活性。本文讨论了ac4C的检测技术及其调控机制,并总结了ac4C与肿瘤发生、发展、预后和药物治疗的...