DeePMD深度势训练需要提前准备数据集,训练数据集的生成有两种方式:使用DP-GEN Init_bulk命令或者使用第一性原理(Abacus、cp2k等)计算。 Abacus计算和lammps模拟类似,需要先有结构文件STRU,STRU文件包含了原子类型、mass、赝势和轨道文件名称以及原子坐标信息。 如果对STRU结构文件比较熟悉,可以手动编写STRU文件。 当然,最...
DeePMD-kit:ABACUS与DeePMD-kit接口,允许将ABACUS作为分子动力学引擎执行DeePMD模拟。 DP-GEN:用于生成DeePMD训练集的深度势能生成器,通过迭代探索未知配置空间并选择性地添加新候选配置到训练集中。 DeepH:基于等变图神经网络的DFT哈密顿量建模方法,与ABACUS接口,支持自旋轨道耦合和磁性系统。 DeePTB:结合ABACUS进行DFT计...
5. 安装DeePMD支持 ABACUS安装方法简介 [Easy Installation — ABACUS documentation (deepmodeling.com)](...
ABACUS准确性测试，ABACUS+DPGEN准备初始训练集，ABACUS+DPGEN+LAMMPS+DeePMD丰富训练集，lammps做扩散模拟...
在原子尺度模拟中，机器学习方法DeePMD已经成为解决复杂系统的有力工具。传统的密度泛函理论（DFT）计算，通过求解Kohn-Sham方程，为训练DP势函数提供了基础数据。然而，随着体系温度的上升，DFT的计算量剧增，特别是在处理高温时，Kohn-Sham方程的求解变得极其耗费资源。北京大学的研究团队，陈默涵研究员与他的...
#if use deepks and deepmd cmake -B $BUILD_DIR -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$PREFIX -DMKLROOT=$MKLROOT -DELPA_DIR=$ELPA -DCEREAL_INCLUDE_DIR=$CEREAL -DLibxc_DIR=$LIBXC -DENABLE_LCAO=ON -DENABLE_LIBXC=ON -DUSE_OPENMP=ON -DUSE_ELPA=ON ...
ABACUS 3.0版本主要新功能包括：1. 结合 DeePKS 方法，通过神经网络修正项优化泛函模型，用于周期性体系的快速准确第一性原理计算；借助 dflow 实现的迭代流程简化训练过程。2. 结合 DP-GEN，为 DeePMD-kit（分子动力学模拟软件）提供标签数据生成，支持 init_bulk 和 run 模块进行势函数训练；DP-GEN...
After my test, you needgcc>11.3.1 to enable deepmd feature in ABACUS. Intel-oneAPI problem ELPA problem via Intel-oneAPI toolchain in AMD server The default compiler for Intel-oneAPI isicpxandicx, which will cause problem when compling ELPA in AMD server. (Which is a problem and needed to...
在预测精度方面,ABACUS支持局域密度近似(LDA)、广义梯度近似(GGA)、metaGGA、杂化泛函等多种交换关联泛函,以及结合AI的DeePKS、DeePMD等多种方法。ABACUS开发团队以支持高精度、高稳定性、多平台、大规模计算为建设目标,以开源模式进行线上协同开发,通过构建高通量、跨平台自动化测试工作流,确保ABACUS在功能、性能和...