4D-Label free蛋白质组学是基于timsTOF Pro2离子淌度平台的非标记定量蛋白组学技术。该技术是对传统Label free蛋白质组学的升级,在前三个维度的基础上增加了第四个维度,离子淌度(mobility)可以对离子的形状和截面进行分离,能够区分m/z差值非常小的离子(离子迁移率不同)大幅提高离子利用率和准确度,以更少上样量、...
| 华盈生物4D蛋白质组学服务 目前TIMS技术和FAIMS技术分别被Bruker和Thermo Fisher公司运用到蛋白质组学研究领域的质谱仪开发中,分别命名为Exploris 480+FAIMS pro和timsTOF Pro。华盈生物同时拥有该两款主流的质谱仪,可根据实际应用场景为客户提供匹配的4D质谱仪和对应的蛋白质组学检测技术。 经过大量项目测试发现:Ti...
4D-DIA非标定量蛋白质组学利用高分辨率质谱仪进行质谱分析，具有较高的灵敏度。这意味着可以检测到低丰度的蛋白质，从而更全面地了解样品中的蛋白质组成。传统的蛋白质组学技术往往对低丰度蛋白质的检测有一定的局限性，而4D-DIA非标定量蛋白质组学可以克服这一问题。3. 全面的蛋白质组学分析 4D-DIA非标定量蛋白质...
相较于传统的3D蛋白质组学,4D蛋白质组学有以下优势: 定性更准确:离子淌度分离可有效区分修饰同分异构问题,使修饰鉴定结果更加准确。 鉴定蛋白数更多:4D蛋白质组检测通量可提升至普通蛋白组的10倍,有效降低实验周期。 定量更准确:仪器稳定性更好,1-96针样本间相关系数可达0.95以上。
4D-DIA蛋白质组学是基于Tims TOF Pro离子淌度平台的新一代DIA技术。与传统的DIA不同，4D-DIA主要通过数据非依赖采集-同步累积连续碎裂（diaPASEF）扫描模式进行差异定量蛋白质组学分析。依托于diaPASEF技术的4D-DIA蛋白质组学，同时集合了4D蛋白质组和DIA技术的优势，在实现高扫描速度和高灵敏度的同时，克服了DIA原...
4D蛋白质组学在传统3D保留时间（retentiontime）、质荷比（m/z）、离子强度（intensity）这三个维度分离基础之上增加了第四维肽段的碰撞截面积（CCS）--离子淌度（mobility）的分离，重新定义了蛋白质组学的分析标准。4D蛋白质组学基于timsTOFPro上的PASEF技术，大幅度的提高质谱扫描速度和检测灵敏度，实现蛋白质组学...
图1. 新一代4D-蛋白质组学示意图 4D组学新时代!引领高通量蛋白质组学 蛋白质组学不仅仅是寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一,而且在对癌症、老年痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面也有十分诱人的前景。高通量蛋白组学则成为了生物医学基础研究和应用开发的重要前沿和突破口,而如何实现对大队列样本稳...
1. 时间维度:4D蛋白质组学关注蛋白质在时间上的变化。通过对不同时间点或时间段的样品进行蛋白质组学分析,可以研究蛋白质的表达水平、修饰和功能等的动态变化。例如,在细菌的感染过程中,可以通过4D蛋白质组学研究分析感染前后蛋白质表达的变化,从而揭示病原体与宿主相互作用的机制。 2. 空间维度:4D蛋白质组学关注...
4D-DIA蛋白质组学 传统的蛋白质组学是基于肽段保留时间、离子强度和离子质荷比这三个维度对蛋白组进行检测分析，4D蛋白质组学在传统的三维分离基础上增加了离子淌度这一维度，提高了质谱仪器的检测性能和蛋白质组学的分析标准。4D蛋白质组学基于timsTOF Pro以及双TIMS和PASEF技术，大幅度的提高了数据采集速度、检测...
Proteomic and phosphoproteomic landscapes of acute myeloid leukemia ”的研究成果，本篇运用4D蛋白组学、TMT标记定量蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、Western blotting等研究从LAML TCGA数据集的44名有代表性急性髓系白血病（AML）患者和6个健康的骨髓来源对照组中开发了一个深度蛋白质组和磷酸化蛋白质组数据库。