型号:4D LFQ定量蛋白质组学分析 样本: 杭州景杰生物科技股份有限公司 获取底价在线客服 查看同类蛋白质组和生物质谱仪器 型号品牌PIPES指数 蛋白质测序百泰派克9.4 DIA蛋白质组学中科新生命8.8 DIA技术鹿明生物8.8 仪器相关信息 仪器描述 最新仪器 标准 口碑 ...
本篇运用4D蛋白组学、TMT标记定量蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、Western blotting等研究从LAML TCGA数据集的44名有代表性急性髓系白血病(AML)患者和6个健康的骨髓来源对照组中开发了一个深度蛋白质组和磷酸化蛋白质组数据库。
本篇运用4D蛋白组学、TMT标记定量蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、Western blotting等研究从LAML TCGA数据集的44名有代表性急性髓系白血病(AML)患者和6个健康的骨髓来源对照组中开发了一个深度蛋白质组和磷酸化蛋白质组数据库。
1. 深层AML蛋白质组研究 作者运用LAML TCGA样本集,从44个完全特征化的AML骨髓样本中获得了蛋白质提取物,这些样本代表了广泛的AML亚型,跨越了细胞遗传风险、常见突变和驱动融合的范围(图1)。随后对44名患者样本以及3份健康对照骨髓样本进行了label-free(LFQ)和TMT标记定量蛋白质组学研究。由于AML细胞含有丰富、高...
为了分析4D质谱对蛋白定量的准确性,研究者从皮尔森相关系数、中位数变异系数、缺失值和定量准确度这四个统计角度进行了研究。在2h梯度、4次技术重复的条件下平均鉴定到5575个蛋白,结果显示蛋白信号值的皮尔森相关系数为0.979,表明实验的重复性非常好(图3A)。MaxLFQ归一化以后,中位数变异系数为7.2%(图3B)。进一步,...
为了分析4D质谱对蛋白定量的准确性,研究者从皮尔森相关系数、中位数变异系数、缺失值和定量准确度这四个统计角度进行了研究。在2h梯度、4次技术重复的条件下平均鉴定到5575个蛋白,结果显示蛋白信号值的皮尔森相关系数为0.979,表明实验的重复性非常好(图3A)。MaxLFQ归一化以后,中位数变异系数为7.2%(图3B)。进一步,...
4D蛋白质组学是在3D分离即保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度的基础之上增加了第四个维度--离子淌度(mobility)的分离(图1),进而大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、...
研究团队首先通过体内实验发现DHA处理组相比对照组脾脏长度显著增加,进一步对DHA和CMC (羧甲基纤维素溶剂对照) 处理组之间的脾细胞进行了定量蛋白质组学分析,结合生物学信息分析结果表明DHA可能参与细胞周期信号通路的激活。为了阐明DHA对细胞周期相关蛋...
技术优势 相较于传统Label-free蛋白质组,4D Label-free蛋白质组检测深度更高,需求样本量更少,离子利用率高,在谱图预处理方面,4D-LFQ能够根据离子淌度和m/z特征去除掉单电荷离子从而减少共流出效应。 技术路线 信息分析流程 前台: 010-82837801 客服: 400-658-1585 中国· 美国 · 英国 · 德国 · ...
timsTOF Pro 2 可以通过数据库搜索和运行之间的匹配,在一些日常细胞系蛋白组定量实验中实现很高的蛋白覆盖深度。 4、timsTOF Pro2实现高灵敏度、高通量靶向蛋白质组学 和传统的靶向蛋白组学分析技术(SRM 和 PRM)相比,prm-PASEF 在单针中可极大提高监测多肽数目,同时不影响仪器选择性或灵敏度。