4C ),可以捕获一个基因区域其他区域间的互相作用。该技术不需要知道作用区域的先验知识就可以使用。
在4C的基础上,5C技术添加了标签,能检测多种点之间的相互作用,进一步增强了检测能力。Hi-C技术则是通过甲醛交联、限制酶切割、末端补平添加生物素、平末端连接、超声破碎、生物素富集、建立库并进行测序,整个过程中没有特异性引物。Hi-C技术凭借高通量测序,展示了整个染色体中的全部相互作用关系。ChIA...
5C技术是在4C的技术上,加了个tag标签,导致可以检测many-to-many的相互作用。 Hi-C (all-vs-all) Hi-C使用了高通量测序的方法,理论上它能够捕捉到所有的基因间的互作。HiC基本步骤是,甲醛交联,限制酶切,末端补平加biotin,平末端连接,超声破碎,biotin富集,建库测序。整个过程是没有特异性引物存在的。而且依靠高...
5C技术是在4C的技术上,加了个tag标签,导致可以检测many-to-many的相互作用。没啥说的。 Hi-C的基本步骤是,甲醛交联,限制酶切,末端补平加biotin,平末端连接,超声破碎,biotin富集,建库测序。整个过程是没有特异性引物存在的。而且依靠高通量的测序技术,Hi-C可以展现出,整个染色体all-to-all的...
5C (many-vs-many) 主要多基因与多基因的互作。5C技术是在4C的技术上,加了个tag标签,导致可以检测many-to-many的相互作用。 Hi-C (all-vs-all) Hi-C使用了高通量测序的方法,理论上它能够捕捉到所有的基因间的互作。HiC基本步骤是,甲醛交联,限制酶切,末端补平加biotin,平末端连接,超声破碎,biotin富集,建库...
3C技术适用于评估两个目标区域之间的空间相互作用 4C技术适用于捕获染色质某一区域与全基因组其他区域间相互作用(一对多) 5C技术适用于同时捕获染色质多个区域之间相互作用(多对多) 技术类型及区别 看看yue lab网站上的几种数据: Hi-C Virtual Hi-C ChIA-PET ...
血浆蛋白质组能够对患者群进行亚表型分析,从而预测疾病严重程度和结果。基于系统的综合分析,包括所有模式的张量和矩阵分解,揭示了与流感和败血症相比与严重性和特异性相关的特征分组。我们的方法和血液图谱将支持COVID-19未来药物开发、临床试验设计...
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主要多基因与多基因的互作。5C技术是在4C的技术上,加了个tag标签,导致可以检测many-to-many的相互作用。 ◆Hi-C (all-vs-all) Hi-C使用了高通量测序的方法,理论上它能够捕捉到所有的基因间的互作。HiC基本步骤是,甲醛交联,限制酶切,末端补平加biotin,平末端连接,超声破碎,biotin富集,建库测序。整个过程是没...
3C最早,只能做某一些特殊点的,4C把范围扩大了一些,到HiC,可以给出整个染色体上所有loci之间的相互...