原子 RNA 聚合酶 V (Pol V ) 与 DRD1 协作(在 RNA 依赖的 DNA METHYLATION 1 缺乏) 招募在被假设绑在 siRNA-AGO4 建筑群并且随后的包含不同颜色的 loci 产生抄本 de-novo DNA methylation 或 histone 修改机械.这里,我们报导主要 pericentromeric 重复和包含不同颜色的标记 histone H3 离氨酸的弄空的那 ...
the 24-nt heterochromatic siRNAs (hc-siRNAs); DCL3 can process mRNA substrates, as demonstrated from tasiRNA loci in the Arabidopsis dcl2/4 double mutant12. DCL3 is conserved in all eudicot species we examined (Supplementary Fig. 3A). Many eudicot lineages demonstrated duplicated DCL3 genes, ...
结果表明,弱势粒24-nt siRNA表达量高于强势粒,而DNA甲基化水平低于强势粒.在CG,CHG和CHH等DNA甲基化中,CG类甲基化水平在强弱势粒间没有差异,而CHG和CHH类均存在较大差异,均表现为强势粒甲基化水平高于弱势粒.强弱势粒间CHG和CHH类甲基化差异是导致DNA甲基化差异的主要原因,而弱势粒24-nt siRNA表达量高可能是...
Analysis of non-miRNA, non-tasiRNA hotspots of small RNA production within the genome of the moss Physcomitrella patens revealed multiple loci that consistently produced a mixture of 21-24 nt siRNAs with a peak at 23 nt. These Pp23SR loci were significantly enriched in transposon content, ...
A. et al. Specificity of ARGONAUTE7-miR390 interaction and dual functionality in TAS3 trans-acting siRNA formation. Cell 133, 128–141 (2008). Article CAS Google Scholar Zhu, H. et al. Arabidopsis Argonaute10 specifically sequesters miR166/165 to regulate shoot apical meristem development. ...
Montgomery, T. A.et al.Specificity of ARGONAUTE7-miR390 interaction and dual functionality in TAS3 trans-acting siRNA formation.Cell133, 128–141 (2008). ArticleCASGoogle Scholar Zhu, H.et al.ArabidopsisArgonaute10 specifically sequesters miR166/165 to regulate shoot apical meristem development.Ce...
可以采用化学修饰的方法,比如2'羟基甲基化修饰,磷酸硫代修饰,氟代修饰等常规修饰方法,都可以保证siRNA的稳定性,当然也有学者可以在siRNA的链后面悬挂两个单独碱基T。还...
植物Small RNA(sRNA)是指植物细胞内长度为20~24nt的小片段RNA,其广泛参与植物的生长、发育和生殖等过程。植物中sRNA的主要成员有siRNA(小的干扰RNA)和micro RNA(miRNA),而phased siRNA(相位siRNA,即phasiRNA)是siRNA中重要的一类,与植物生长发育或抗病等密切相关。
水稻是我国重要粮食作物,解析其雄性不育机制促进两系和三系法杂交育种,对于保障粮食产量具有重大意义。phasiRNAs是植物中一类特殊的siRNA,它的生成依赖于22-nt miRNA/AGO蛋白沉默复合体(RISC)切割长非编码转录本(如TAS和PHAS)或者NB-LRR等编码基因转录本所触发,随后RNA依赖的RNA聚合酶6(RDR6)将切割靶点下游的片段合...
Pol IV dependent siRNA biogensis Pol VI缺陷突变体证明超过90%的24nt-siRNAs来自Pol VI,而这些24nt-siRNAs会引起甲基化事件。 Pol VI结合到TE和重复序列上的机制尚不完全清楚; 首先SAWADEE HOMEODOMAIN HOMOLOGUE 1 (SHH1)会招募Pol VI, SHH会通过串联的Tudor-like fold结合到甲基化的H3K9和没有甲基化的H3K4。