R语言ggpubr绘制小提琴图(violin plot)之分面调整 R语言pheatmap绘制基因表达热图 R语言ComplexHeatmap绘制基因表达热图(并添加生存时间的散点图注释) R语言绘图之选色技巧笔记 R语言clusterProfiler包GO富集分析(enrichplot包、GOplot包和ggplot2绘图)
一般来说,在异质性较小的情况下,尽量使用固定效应模型,对于异质性较大的情况,则应先试着去除异质性,然后使用固定效应模型;对于存在较大异质性且这种异质性难以去除时,可以考虑使用随机效应模型。 第一步,利用昨天生成的mtc.network结果并建立mtc.model,昨天的内容参见网状Meta分析之R语言‘gemtc’包实战(1) model_...
同样,我们也可以使用更常用的apyramid包,进行金字塔图(pyramid plot)的绘制。可参考其他教程。 医学统计数据分析分享交流SPSS、R语言、Python、ArcGis、Geoda、GraphPad、数据分析图表制作等心得。承接数据分析,论文修回,医学统计,空间分析,问卷分析业务。若有投稿和数据分析代做需求,可以直接联系我,谢谢!
首先查看比对到参考基因组上的数据比对结果。 代码语言:javascript 代码运行次数:0 复制 Cloud Studio代码运行 // ###在分析之前建议用biocmanager装包 省时省力library(dplyr)library(stringr)library(ggplot2)library(viridis)library(GenomicRanges)library(chromVAR)## For FRiP analysis and differential analysislibrary...
R语言是一种免费的、开源的、跨平台的软件环境,它主要用于数据的处理、统计分析和绘图。R语言呈现出了具有缜密性、高效性和灵活性的特点。它是由新西兰奥克兰大学的Ross Ihaka和Robert Gentleman开发的,并在GNU计划下实现。 二、数据处理 R语言的数据处理能力是它的一大特色。它提供了一系列用于数据处理的函数和库。
ggplot2不仅是R语言中最流行的数据可视化包，它也是一个生态系统。大量的附加包为ggplot提供了更强大的功能，从更容易地更改轴标签到自动生成统计信息，再到自定义……几乎任何事情。下面是您应该了解的12个很棒的ggplot2扩展——最后还有一些额外的扩展。一、创建自己的geoms: ggpackets 一旦您添加了多个层并对...
本文旨在介绍R语言中ggplot2包的一些精细化操作,主要适用于对R画图有一定了解,需要更精细化作图的人,尤其是那些刚从excel转ggplot2的各位,有比较频繁的作图需求的人。不讨论那些样式非常酷炫的图表,以实用的商业化图表为主。包括以下结构: 1、画图前的准备:自定义ggplot2格式刷 ...
步骤1:加载ggplot2包 在R语言中,我们使用library(ggplot2)函数来加载ggplot2包,这样我们就可以使用其中的函数和方法。 library(ggplot2) 1. 步骤2:生成符合正态分布的随机数据 为了绘制正态分布图形,我们首先需要生成符合正态分布的随机数据。这里我们生成1000个随机数,并将其存储在一个数据框中。
6. tidycmprsk包(★★★) 上一篇推文介绍了前3个包绘制竞争风险累计发生率(CIF)的代码 (R语言 | 26. 竞争风险分析 : 累计发生率曲线-1),本推文介绍tidycmprsk包绘制CIF图的代码。 竞争风险分析 竞争风险(Competing Risk):一个患者身上可能有多个终点事件,如,因癌症死亡和因其他事件死亡哪个先到来,它俩互为...