如果需要全面了解微生物群落信息,且预算充足,16S检测更为实用。 如果只需要了解部分细菌种类,且希望降低成本,V3-V4区测序更为实用。 因此,在选择时需要根据具体的研究目的、预算和样本类型来决定。
定位V3-V4区域通常需要参照已知的保守区域位置。V3-V4区域是16S rRNA基因中最常用的扩增区域之一，因为这...
本试剂盒是专门为细菌16S rDNA 的V3-V4 区域设计的二代测序文库制备试剂盒,适用于illumina 平台。本试剂首先将16S rDNA 的V3-V4 区域进行特异性扩增,然后进行末端修复及“A”尾添加、接头连接等步骤,构建出完整的illumina文库。本试剂盒目标区域约450bp,推荐使用illumina Miseq平台PE300或Novaseq PE250策略进行测序...
本制品是使用Illumina公司MiSeq对细菌丛16S rRNA进行解析时使用的PCR扩增试剂盒。以细菌16S rRNA基因的V3-V4区域为对象,使用对多样序列能有效扩增的PCR酶Tks Gflex™DNA Polymerase进行扩增。 引物是采用设计在常用的高效扩增区域(V3-V4)上的341F、806R(见图1),在引物的5’端连有Illumina MiSeq用的overhang序列。
16S rRNA基因的V3-4区域和V4区域在进行微生物群落分析时有一些不同的特点。 1.序列覆盖范围: V3-4区域:覆盖16S rRNA基因的第三和第四可变区。这个区域比V4区域更长,提供更广泛的序列信息。 V4区域:只包含第四可变区。这个区域较短,但仍能提供关于微生物群落的有用信息。
16S(V3V4)细菌扩增子建库试剂盒利用高通量测序技术对16S rDNA中V3-V4区片段进行扩增,结合生物信息学技术,检测特定环境下的微生物(主要是细菌),鉴定所检细菌种类,提供环境样本物种分类、物种丰度、种群结构、系统进化等诸多信息。本试剂盒中包含进行细菌16S rDNA扩增的所有试剂,16S扩增引物F/R用于扩增细菌16S rDNA前50...
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您可以针对质控后的数据通过分类工具将序列分类到不同的微生物群落，常用的工具包括：QIIME 2、Mothur、...
【赛默飞 16S V3-V4长片段测序解决方案】大咖讲座视频来啦![赞啊]http://t.cn/AilgVTBr
以呼吸道微生物组研究为例:探索一步或两步PCR方案在16S V3V4与V4基因区域的偏差 谷禾健康 迄今为止,已经有了许多对呼吸道微生物组通过16S rRNA高通量测序的研究。这其中所有基于扩增子的研究的共同之处就是PCR的应用: 一是扩增待测序的目标标记基因,