RDP数据库全称“RibosomalDatabase Project”,该数据库提供质控、比对、注释的细菌、古菌16S rRNA基因和真菌28S rRNA基因序列。主要用其Classifier功能(http://rdp.cme.msu.edu/classifier/classifier.jsp),可非常方便地确定某条rRNA基因序列从门到属/种水平的分类信息并给出各水平相应的置信度。 Greengenes是数据库目...
关键词:病原细菌;16SrRNA;基因序列分析 中图分类号:R3 IdentificationofPathogenicMicroorganisms bySequencing16SrRNAGene ZhuFeizhou 1 ,ChenLiyu 2 ,TianQi 3 ,TanCheng 3 ,OuYangFangdan 1 , ChenHanchun 1 ,WuZhengli 1 (1.DepartmentofBiochemistry,SchoolofBiologicalScienceandTechnology,CentralSouth ...
大肠杆菌单拷贝rrna操纵元菌株的构建及16s rrna基因敲除中的质粒重排 热度: DNA甲基化酶调控的基因表达 热度: ,,, ,,,鱼,皇,璺坌金鱼鱼皇旦皇主,鱼旦鱼鱼基,,,垡旦型,王,丝丝 导 专 论文提交 学位授予 日 日河南农业大学学位论文独创性声明,使用...
19、单位鉴定的结果是表皮 葡萄球菌,而 16S rRNA 基因序列分析法鉴定提示为溶血性葡萄球菌。菌种保存单位表 1 16S rRNA 基因序列分析法鉴定结果16S rRNA 基因序列分析法鉴定结果两者结果比拟提供的菌名 英文名 中文名大肠埃希菌 Escherichia coli 大肠埃希菌 “种一致 伤寒沙门菌 Salmonella enterica 肠道沙门菌 “种一...
rRNA指的是rDNA的转录产物,它是构成核糖体的重要成分,核糖体由许多小的rRNA分子组装而成,16S rRNA是其中一个元件。 所以我们研究16S菌群测序的对象都是DNA,而不是RNA。 绝对丰度和相对丰度 目前的16S rRNA扩增⼦测序只能检测微生物群落的相对丰度,不能得到绝对的丰度。
16SrRNA是微生物的重要分类标志,可以从属的水平上确定微生物的类群,是研 绪论 硕士论文 究微生物群落结构的最有效的手段之一。 氨氧化细菌的16SrRNA基因编码区域中分布着PCR的许多主要位点,PCR技术 的长足进步也推动了氨氧化细菌等难培养微生物的生态学研究。实时定量PCR可以对 ...