Xenium平台以亚细胞分辨率和纳米级精度带来超高多重的原位分析,并提供完整的解决方案,包括全面的基因组合产品,让您能够快速获得可靠的单细胞空间见解。 基因组合 可定制的预设计基因组合或完全定制的基因组合 Xenium分析仪 业界领先的速度和通量,适用于单细胞空间成像 ...
Xenium与哪些样本类型兼容? Xenium基因组合采用统一的分析试剂,与新鲜冷冻和FFPE组织兼容。此外,它使用温和的化学试剂,让组织在Xenium处理后能够进行H&E或IF染色做进一步形态学上的分析。 Xenium可以与其他分析结合使用吗? Xenium是一种非破坏性的分析,Xenium分析后的组织切片可转移至仪器外,进行H&E或IF染色和成像。
5 TIMs空间生态位在皮层中富集 Aβ 斑块和炎症细胞 为了进一步研究人AD背景下的TIMs,作者使用10x Xenium的Human Brain Gene Expression Panel(266个基因),对3个APOE3纯合子和3个APOE4纯合子的人AD皮质组织进行组织原位转录组分析,最终覆盖到494376个单个细胞。作者发现在APOE3和APOE4供体中观察到了明确的TIMs簇,...
Xenium对象已经包含由10x Analyzer生成的细胞多边形数据。如果您想使用其他工具(如Baysor)绘制细胞多边形,请按照以下步骤操作。在生成细胞多边形后,通过运行polygons_cell_mapping将每个多边形与最近的细胞基于欧几里得距离关联起来。最后,需要使用generate_polygon_counts将基因表达值分配给细胞多边形。这一步完全是可选的,可以...
指每个细胞或组织区域内可检测到的转录本总量,是衡量整体基因表达水平变化的重要指标。Xenium与Visium v2在转录本丰度的表现上各有千秋,具体取决于实验设计、测序深度及组织类型等因素。 上述数据比较,来源于最近在《Nature Communications》杂志上发表的一篇论文(2),对Xenium和“标准清晰度的”Visium v2在连续组织切片上...
10X Xenium技术将检测基因提高到5000+ 作者,Evil Genius 不得不说,有钱 + 人才 简直无敌 这是10X今年更新的第三次,继HD、GEM-X之后,将Xenium的技术检测基因由几百提高到了5000. 单细胞空间成像5000个基因在整个组织切片具有特殊的特异性,敏感性和速度
Visium HD和Xenium原位分析 01 Visium HD平台通过创新的探针捕获技术,实现了在空间背景下对组织样本全转录组的无偏分析。该技术将精心设计的探针与载玻片上的组织样本孵育,利用CytAssist自动化系统将结合的探针精准转移到Visium HD玻片上,极大地提高了空间保真度。随后,这些探针被用来生成带有空间条形码的NGS文库,进而生成...
最近发现了一个超酷的科技新品——10X Xenium空间转录组技术,简直是科研界的黑科技!这个技术基于padlock技术,能提供多种组织的panel,包括feature基因和自选基因,让你在单细胞水平和组织层面都能看到单个转录本的分布。首先,这个技术真的很方便。10X Xenium Analyzer软件简单易用,高吞吐量,数据收集和处理都同步进行,数据...
进行细胞核染色后将组织载玻片置于Xenium分析仪中进行荧光基团杂交,一共有4种荧光,荧光基团与探针上“Gene Specific Barcode”中序列杂交,杂交位置会在激发光的照射下发出对应颜色的荧光,一轮杂交后不同探针会分别呈现4种颜色荧光中的一种荧光颜色,没有被杂交上的不发光,荧光显微镜把该轮荧光染色整张片子各个位置荧光...
10x Xenium原位空间转录组 Xenium空间原位分析技术是10x Genomics继Visium和CytAssist空间转录组技术后推出的又一重磅空间组学技术。相较于Visium和CytAssist,Xenium的分辨率达到了亚细胞水平(0.2μm),且能原位捕获RNA的表达信息。此外,Xenium分析的操作过程对切片无损,因此完成Xenium 分析后的切片还可以做H&E、IF染色及...