10x Genomics Chromium GEM-X单细胞解决方案,是基于Chromium X系列仪器,将单细胞基因表达(3’)kit升级为Chromium GEM-X Single Cell Gene Expression v4,将单细胞免疫组(5’)kit升级为Chromium GEM-X Single Cell Immune Profiling v3,此次试剂的升级,将大幅提升单细胞检测的性能,助力拓展肿瘤、免疫、发育、疾病等...
10x Genomics Chromium GEM-X单细胞解决方案,是基于Chromium X系列仪器,将单细胞基因表达(3’)kit升级为Chromium GEM-X Single Cell Gene Expression v4,将单细胞免疫组(5’)kit升级为Chromium GEM-X Single Cell Immune Profiling v3,此次试剂的升级,将大幅提升单细胞检测的性能,助力拓展肿瘤、免疫、发育、疾病等...
AD*APOE3和AD*APOE4),然后取了10周、20周、96周龄并且具有不同APOE基因型的小鼠海马、皮质区域,使用10x Genomics的3’V3以及5’V2单细胞技术,获得了30868个细胞的单细胞图谱,通过对小胶质细胞进行进一步的分析,最终发现了一群终末期炎症小胶质细胞TIMs,它们几乎只存在于96周龄的...
可以看出来,单细胞转录组的数据准确性其实并不会普通转录组低多少;而10X Genomics技术进行的单细胞转录组测序(GemCode)的准确性更是在同行的多种单细胞转录组技术中都是比较高的。 其次,10X单细胞技术自创立这么多年来也一直革新自己的技术,现在细胞捕获试剂由V2版本更新至V3版本,单个细胞可以获取的转录本数量和基因...
10X V3&V3.1 5'&5'-v2 ATAC&ATAC-v1.1对比 10XGenomics 新旧试剂 使用对比 单细胞小白的实验心得
一、10x Genomics V3的原理概述 10x Genomics V3的核心原理是将单个细胞或基因组DNA分离成数千个小反应液滴,并在每个液滴中进行同步扩增和测序。这种方法能够实现高通量的单细胞基因组或转录组测序,为研究人员提供了更全面、详细的细胞信息。 二、10x Genomics V3的工作流程 1. 样品准备:将需要测序的细胞或DNA样品...
A9:10x Genomics 3' 单细胞转录组测序单个细胞捕获效率高达65%,捕获多个细胞的概率极低,约为0.9%/1000 cells。 Q10:单个细胞所测的数据量一般为多少? A10: 10x 官方推荐数据量50K reads per cell (Single Cell 3' v2试剂盒,现已更新到V3试剂盒,同样的数据量能获得更多的基因数)。若要得到更多的基因或表达...
作者将5×FAD小鼠与小鼠Apoe位点中携带人APOE2、APOE3或APOE4等位基因的小鼠杂交以获得AD * APOE系(以下称为AD*APOE2、AD*APOE3和AD*APOE4),然后取了10周、20周、96周龄并且具有不同APOE基因型的小鼠海马、皮质区域,使用10x Genomics的3’V3以及5’V2单细胞技术,获得了30868个细胞的单细胞图谱,通过对小胶质...
10X Genomics 的 Cell Ranger 软件相关的,用于处理条形码(barcode)的功能模块。 目录结构概述 3M-february-2018.txt.gz 9K-LT-march-2021.txt.gz visium-v1_coordinates.txt visium-v2.txt visium-v5.gal 737K-april-2014_rc.txt __init__.py visium-v1.gal visium-v3_coordinates.txt visium-v5.txt ...
近期,10x Genomics发布Visium HD空间转录芯片,可提供2x2um分辨率的高质量的数据,以微米级的分辨率从组织中获得全面的转录组数据,以确定精细解剖结构的细胞组成,实现了单细胞级别的空间转录组数据分析。 同时,又推出了新一代单细胞技术 GEM-X,也为3'基...