Linked-Reads是由10x Genomics公司开发的测序技术,利用微流体方法对HMW DNA进行分离并添加条形码,通过该方法生成的数据可以从短序列中提供基因组的上下文信息。我们的技术允许您将多个实验合并到一个单一的、功能强大的工作流程中,并降低对起始样本量的要求。简而言之,Linked-Reads从短读长的测序数据中提供了远程信息,所...
什么是10x genomics linked reads技术,以及它的应用和优点。 10x genomics linked reads技术是一项用于基因组解析的高通量测序技术。通过该技术,可以实现对大规模个体之间的基因信息进行并行化的、高通量的读取。 这种技术的关键是将DNA分子与包含随机条形码的微珠反应,以生成一个包含DNA和条形码的复合物。然后,这些复合...
10X-Genomics-辅助长片段组装Linked-reads All graphics from 10X Genomics
图4 兰花形态进化中涉及到的MADS-box基因博奥晶典10X Genomics基因组优势 1. 仅需构建一个10X Genomics 文库，成本超低。2. 大跨度 Linked-reads为Contig准确组装成Scaffold提供充分支持。对已有的基因组序列能够有效延长Scaffold长度。3. 作为国内第一家引进10X Genomics平台的服务商，博奥晶典已成功建库300+个...
10X Genomics已经广泛应用于单细胞测序、组装领域,现在也是火的不行。 10X Genomics原理 通过将来自相同DNA片段(10-100kb)的reads加上相同的barcode,然后在illumina平台上进行测序,从而实现长片段的测序。其基本原理是同一长片段的reads会具有同样的标签,称为linked-reads,利用这些barcode的信息,可将短reads拼接为长reads...
Genome Medicine: linked read sequencing解决胃癌转移中复杂的基因组重排问题 基因组重排是许多恶性肿瘤中关键的致癌驱动事件。然而,即使使用全基因组测序,癌症基因组重排的结构鉴定和分辨仍然具有挑战性。 本文研究者通过10x Genomics的linked-reads方法结合测序来鉴定致癌基因组重排。该方法依赖于微流体液滴技术,文库来自...
利用GemCode平台对长片段序列进行扩增引入barcode序列以及测序接头引物,然后将序列打断成适合测序大小的片段进行测序,通过barcode序列信息将多个Reads进行组装,获得跨度在30-100Kb的linked-reads信息,从而获得大片段的遗传信息。技术的优势在于:1)通过该技术构建的文库可与Illumina测序系统完美匹配,将短Reads组装成长达100Kb的...
美国Chromium全息基因解码系统是10x Genomics公司的产品,和该公司前一代产品GemCode相比,微反应体系数量提升至一百万个,标签数量提升至四百万种。该系统能同时将基因组分析,外显子分析和单细胞转录组分析三种应用集成在同一个系统上。Chromium系统*的Linked Reads技术可以带来Mb级的测序长度和超低成本的高通量单细胞...
把带有相同突变点的 linked reads 归类,可以分成两个大组。 我们不难想到,其中一组 linked reads 来自于父亲;另一组 linked reads 来自于母亲,这样我们就把父源和母源的两条染色体各自的单倍体型分析出来。 举例 以NA12878样本为例,传统的二代测序(灰...
10x Genomics主要有两种技术,一个是可以测试DNA短序列的Linked-Reads,另一个是对单细胞进行RNA测序的scRNA-Seq。 Linked-Reads能够对DNA进行短读取以获取大量基因组信息。它通过对HMW DNA进行分区和编码,形成新的数据信息,再从这些短读取的信息中,获得完整的基因组信息。这种创新技术可以应用到多种检测过程当中,比如在...