10x Genomics 单细胞平台由于其成本优势和通量优势,在市场上处于绝对优势。10x Genomics利用液滴法的原理,通过微流控、油滴包裹和Barcode标记等技术,实现大规模的单细胞分离、标记,主要流程包括以下步骤: Step0、Prepare your sample(样品制备):酶解样品,制备单细胞悬液 Step1、GEM generation(生成油包水结构体系) St...
小果会从样本的制备开始,然后讲解10×genomics文库构建和测序的原理及其优势。 单细胞样本制备 单细胞样本的制备有以下几种方法。 1.Limiting dilution极限稀释 这一种常用的技术,手动使用移液器通过稀释分离单个细胞。这种方法效率比较低。 2.Micromanipulation显微操纵术 该技术非常经典,曾用于从早期胚胎或未培养的微生...
10x Genomics单细胞转录组测序(single cell RNA-seq, scRNA-seq),能够以高通量和单分子分辨率研究单个细胞表达谱,揭示复杂细胞群体的异质性,避免单个细胞的基因表达信号被群体的平均化所掩盖。 图1 10x Genomics的技术原理 基迪奥生物拥有的10x Genomics Chromium™系统,是目前单细胞转录组研究领域通量最高,定量最准...
基于10X Genomics 平台的高通量单细胞 RNA Seq技术是利用液滴法的原理,使用GemCode技术,通过控制微流体的进入,将带有 barcode、UMI(Unique Molecular Index,分子标签)、引物及酶的凝胶珠(Gel Beads)与单细胞混合,从而实现大规模的单细胞分离,以及单细胞文库构建的技术。 图1 10X Genomics 技术原理示意图 10X Genomics...
single cell RNA-seq的barcode这么神奇,我们结合10x Genomics的说明书一起来分步骤详解一下。 先来看看这些区段都是用来做什么的。 由内向外: Poly(dT):用来和polyA结合,捕获mRNA UMI:用来标记不同的PCR产物(数count) 10xBarcode:用来标记不同的细胞
10x Genomics Chromium Single Cell ATAC Solution(10X scATAC-seq)是10 X Genomics新推出单细胞表观基因组学水平上揭示染色质可接近性的研究策略。通过单细胞染色质可接近性图谱构建,不仅能清晰了解染色质结构,还可以绘制高分辨率转录因子调控网络,为深入了解疾病的诊断和治疗铺平道路。
10x Genomics测序原理主要是利用液滴捕获技术,通过微流控分选单个细胞,然后让带有barcode和引物的磁珠与细胞结合,被油滴包裹形成油包水结构。这样就能实现对大量细胞的快速高效标记、测序和分析,从而获得单细胞水平的转录表达信息。简单来说,就是利用这种技术,我们可以了解到每个细胞的mRNA表达特征,进一步分析不同细胞群之...
10X genomics单细胞VDJ测序是一种全面的研究免疫组库的方法,能够在单细胞基础上对数百个至数万个人或小鼠的T细胞和B细胞中适应性免疫反应的细胞背景和免疫组库进行同时分析。再加上Feature Barcoding技术,还能检测和分析更多的细胞数据——例如细胞表面标志物和抗原特异性等,从而加强免疫细胞表型分析,以及研究淋巴细胞和...
第三种是大家熟知的10x Genomics平台(图4),基于Drop-Seq技术,使用液滴法形成隔离单细胞的腔室。它的原理是在微流控芯片中将带有barcodes的凝胶珠和单细胞结合形成微油滴(GEM,Gel bead in emulsion),微油滴内单细胞裂解后进行逆转录反应;破油后进行c...