2.10x Genomics Chromium的优势：a. 如果你需要分析大量细胞，尤其是在寻找稀有细胞类型或进行细胞群体...
4.Valid UMIs：有效的UMI数占总的reads的比例；5.Sequencing Saturation：测序饱和度；就是在当前测序深...
虽然在之前Illumina遇到了一些困难,然而,该公司是基因测序市场的主导力量,拥有 10 亿美元现金,每季度的研发支出超过年度支出的 10 倍。 因此,在未来几年里,Fluent可能会成为 10x 业务的主要竞争对手。 第一季度亏损严重,诉讼导致业绩下滑 4 月底,10x Genomics公司发布了2024 年第一季度财报。 收入同比增长 5%,达到...
推荐应用领域:10x Genomics的单细胞测序技术在细胞图谱构建、细胞异质性及组织微环境研究、免疫调控研究等多个领域都有广泛的应用,显示出其技术的广泛适用性和深度解析能力。 至于bd的单细胞测序技术,虽然也是业界知名的技术平台,但在具体的技术细节、样本处理经验以及推荐应用领域上,可能会与10x Genomics存在一定的差异。
方法：10x Genomics高通量单细胞转录组测序（由欧易生物提供技术支持）研究背景 本研究首次通过scRNA-seq分析了免疫细胞和基质细胞在宫颈癌进展过程中转录状态的变化，包括正常组织、HSIL、肿瘤和淋巴结转移灶。本研究将有助于更深入地了解宫颈癌进展过程中TME的细胞特征，并有助于开发抑制宫颈癌的起始和进展的新治疗方法...
10X 单细胞RNA测序(10X Genomics single-cell RNA sequencing, 简称 10X scRNA-seq)是一种基于微流控技术的高通量单细胞RNA测序方法,用于研究细胞的转录组特征,揭示不同细胞类型和状态的差异。它能帮助我们在单细胞水平上解析复杂生物样本的基因表达图谱。以下是10X scRNA-seq的工作原理和步骤: ...
作者对3例正常宫颈,2例高阶段的上皮内病变(High-stage intraepithelial neoplasia,HSIL),4例宫颈肿瘤和1例转移性淋巴结的新鲜组织样本进行10· Genomics高通量单细胞转录组测序,绘制了宫颈癌不同阶段免疫微环境和转录调控网络,不同的免疫微环境意味着不同的免疫治疗策略。这项研究加深了人们对宫颈癌进展过程中肿瘤免疫...
作者对3例正常宫颈,2例高阶段的上皮内病变(High-stage intraepithelial neoplasia,HSIL),4例宫颈肿瘤和1例转移性淋巴结的新鲜组织样本进行10× Genomics高通量单细胞转录组测序,绘制了宫颈癌不同阶段免疫微环境和转录调控网络,不同的免疫微环境意味着不同的免疫治疗策略。这项研究加深了人们对宫颈癌进展过程中肿瘤免疫...
10x Genomics单细胞转录组测序通过微流控分选单个细胞,然后通过带有barcode和引物的磁珠与细胞结合,被油滴包裹形成油包水结构,实现了对大量细胞的快速高效标记、测序和分析,获得单细胞水平转录表达信息,并依据特征基因的表达对不同细胞群进行鉴定和注释,实现样本、细胞群之间的差异分析、细胞演化过程以及细胞与细胞间的相互...
二代测序的建库步骤可以参考这个连接里 https://www.jianshu.com/p/1ccdaea9e822 上面解释过10X Genomics 3'转录组的测序，这种方式获得的测序序列其实都是3' polyA尾巴附近的mRNA序列。为啥呢？因为barcode和UMI在mRNA的3' polyA那一端（二代测序是短读长的测序方法，建库过程中对插入测序片段的...