并且通过Oligo-FisH(荧光原位杂交)对这两个物种的染色体组成进行分析计算,得出六倍体黑龙葵可能是从其二倍体少花龙葵进化而来的(图1),并结合从头预测、ESTs、转录本和蛋白质比对获得六倍体龙葵的基因组信息,对六倍体黑棘豆进行基因组测序、组装和功能注释。
该研究解析了四份光果龙葵 (Solanum americaum)材料的高质量参考基因组,建立了光果龙葵-致病疫霉的ETI(Effector-Triggered Immunity)全景图,并成功克隆到3个新的马铃薯晚疫病免疫受体及其对应的病原无毒蛋白。 马铃薯晚疫病由卵菌(Oomycete)病原微生物致病疫霉 (Phytophthora infestans) 引起,曾经于1845年造成过爱尔兰大...
利用Nanopore和Hi-C技术,完成了龙葵基因组的整个基因组组装。 通过与阿拉伯芥等模式植物的基因组共线性分析,确认龙葵基因组经历了一个独立的全基因组重复事件。 对种子发育过程的转录组进行测序,识别与二羟基脂肪酸合成相关的关键基因。 通过系统发育分析,考察FAD2和FAE1基因家族的进化历史,提出二羟基脂肪酸合成途径的...
为了继续发掘光果龙葵中的马铃薯晚疫病抗性基因,研究团队从世界范围内收集了54份光果龙葵材料,完成了所有材料晚疫病抗性的表型鉴定,利用三代测序技术完成了4份材料的高质量基因组组装和注释,并进行了比较基因组学等分析。为了深入理解光果龙葵的抗性,研究团队手工注释了三个参考基因组中的所有NB-LRR类抗病基因并利用抗...
龙葵曲顶病毒全基因组序列及其检测方法专利信息由爱企查专利频道提供,龙葵曲顶病毒全基因组序列及其检测方法说明:本发明提供了龙葵曲顶病毒全基因组序列及其检测方法,龙葵曲顶病毒全基因组序列全长2867bp,包...专利查询请上爱企查
15所示;根据龙葵曲顶病毒全基因组序列设计了两对检测引物,用于检测植物龙葵曲顶病毒;本发明鉴定了引起龙葵曲顶症状的病毒病原为一种新的双生病毒,并获取了该病毒的全基因组序列,ORF序列及编码氨基酸序列,另外设计了两对特异性强、稳定可靠的检测引物,能够高效可靠检测该病毒,为龙葵曲顶病毒的研究及病害防治打下基础...
胭脂碱合成酶基因在龙葵基因组中的转移.pdf,遗传学报, 11“);456-460s1984 ActaGeneticcaSinics 胭脂碱合成酶基因在龙葵基因组中的转移’‘ 蒋兴郁 邵启全 王大祯 (中国科学院遗传研究所,北京) 〔山西省医药研究所,太原) 利用致瘤农杆菌的三个菌株B3/73,M3/73和 PT
使用CRISPR-Cas9系统生成了一系列具有不同分子剂量靶基因的突变体,通过对突变体的表型分析,从六倍体龙葵中分离出了产量最大的植株。此外,作者将策略应用于孤儿品种Boranong,并成功地生产出了果实产量显著提高的基因改良植株。尽管六倍体龙葵基因组仍处于支架水平,每条染色体的起源尚未确定,但能够定义和编辑同源基因来...
使用CRISPR-Cas9系统生成了一系列具有不同分子剂量靶基因的突变体,通过对突变体的表型分析,从六倍体龙葵中分离出了产量最大的植株。此外,作者将策略应用于孤儿品种Boranong,并成功地生产出了果实产量显著提高的基因改良植株。尽管六倍体龙葵基因组仍处于支架水平,每条染色体的起源尚未确定,但能够定义和编辑同源基因来...
为了研究光果龙葵基因组的进化,对来自15个基因组的代表性蛋白质序列聚类。物种进化树表明,光果龙葵是马铃薯和番茄共同祖先的姐妹物种,并且在大约1410万年前分化出,且染色体重排(CR)是一个重要的进化过程。此外发现光果龙葵基因组之间染色体结构变异(SV)是引起和维持表型多样性的重要原因(图1)。