随后他们将突变位点的进化保守值作为有害程度值,绘制了首个包含基因型维度及有害程度维度的马铃薯有害突变二维图谱,为鉴定马铃薯功能位点及剔除有害突变提供了新依据。 “这就像一个进化透镜。”吴瑶瑶解释说,100份材料基因组序列透过最长8000万年的进化...
“这些材料最长进化时间为8千万年,累计十二亿年的进化时间。”论文第一作者、基因组所博士后吴瑶瑶告诉《中国科学报》,通过追踪这段进化历史的突变积累及选择结果,开发进化透镜,从全基因组层面鉴定进化约束位点及其进化保守值。 吴瑶瑶介绍,他们对这些位点的进化保守程度进行了评估,进化保守值越高的位点更可能具有重要功...
随后他们将突变位点的进化保守值作为有害程度值,绘制了首个包含基因型维度及有害程度维度的马铃薯有害突变二维图谱,为鉴定马铃薯功能位点及剔除有害突变提供了新依据。 “这就像一个进化透镜。”吴瑶瑶解释说,100份材料基因组序列透过最长8000万年的进化、突变及选择,受到了进化约束,利用这个系统可以区分出对繁殖力、...
美国田纳西大学健康科学中心Erik Garrison副教授、莱布尼茨植物遗传学和作物植物研究所Nils Stein教授、加州大学戴维斯分校William J. Lucas教授、列日大学Ludivine Lassois副研究员为本文提供了重要指导。基因组所张春芝研究员、南京农业大学吴...
中国农业科学院深圳农业基因组研究所（基因组所）研究员、中国热科院院长黄三文为通讯作者，基因组所博士后吴瑶瑶、博士后李大伟、硕士生胡勇为该论文的共同第一作者。基因组所博士生李宏博、奥胡斯大学Guillaume P. Ramstein教授，康奈尔大学Edward S. Buckler教授、苏黎世大学Thomas Städler教授、英国自然博物馆Sandra ...
吴瑶瑶介绍,他们对这些位点的进化保守程度进行了评估,进化保守值越高的位点更可能具有重要功能,突变后更可能降低马铃薯繁殖力、生活力及产量,即形成有害突变。随后他们将突变位点的进化保守值作为有害程度值,绘制了首个包含基因型维度及有害程度维度的马铃薯有害突变二维图谱,为鉴定马铃薯功能位点及剔除有害突变提供了新...
基因组所张春芝研究员、南京农业大学吴瑶瑶教授、耶鲁大学博士后唐蝶、中国科学院植物研究所周姚研究员、基因组所杨雨婷、王培、张智洋、张平贤、郑毅、胡勇、练群、马召旭等参与了此研究。 该研究得到了国家自然基金委、国家重点研发计划、广东省、深圳市和农科院的资助。
张春芝,周倩,吴瑶瑶,尚轶,黄三文 马铃薯(Solanum tuberosum)营养全面,是继小麦和水稻之后的世界第三大主食作物。我国是世界上最大的马铃薯生产国,产量约占世界总产量的1/4。但是和主要谷物类粮食作物不同,栽培马铃薯是同源四倍体物种,基因组杂合度更高,遗传分析也更困难。过去马铃薯的基础研究以四倍体为主,重要生物...
中国农业科学院深圳农业基因组研究所(基因组所)研究员、中国热科院院长黄三文为通讯作者,基因组所博士后吴瑶瑶、博士后李大伟、硕士生胡勇为该论文的共同第一作者。基因组所博士生李宏博、奥胡斯大学Guillaume P. Ramstein教授,康奈尔大学Edward S. Buckler教授、苏黎世大学Thomas Städler教授、英国自然博物馆Sandra Knap...
吴瑶瑶介绍,一般情况下,育种家们把育种材料种在地里,需要4个多月的时间才能看到最终的效果,比如产量,要等到成熟之后去测产。而当我们把马铃薯的有害突变二维图谱用于构建全基因组表型预测模型中,我们就能在幼苗期预测产量等性状,知道它是不是我们需要的材料,不需要的材料,就不去种了,这种早期选择,可以大幅度缩短马铃...