散生竹和丛生竹具有极大的差异,本研究首次公布了染色体水平的丛生竹麻竹基因组,该六倍体麻竹基因组揭示了散生竹和丛生竹之间的宏观共线性关系及部分微观共线性的差异,为后续在进化层面及基因功能机制研究提供依据,有望最终能够逐步揭示散生和丛生的分子机制,以及揭示developmental genes (DG)基因所造成的遗传转化...
然而,麻竹基因组较大,倍性复杂,因此其染色体水平的基因组学研究尚未报道。联合团队的研究将麻竹组装成三个分型亚基因组,基于转录组信息,并结合相似性和从头预测等方法,对麻竹三个分型亚基因组共注释了135231个蛋白质编码基因,识别了分型染色体之间存在大量遗传变异,并初步探究了散生竹和丛生竹之间的宏观共线...
散生竹和丛生竹具有极大的差异,本研究首次公布了染色体水平的丛生竹麻竹基因组,该六倍体麻竹基因组揭示了散生竹和丛生竹之间的宏观共线性关系及部分微观共线性的差异,为后续在进化层面及基因功能机制研究提供依据,有望最终能够逐步揭示散生...
麻竹是一种木本丛生竹,生长十分迅速,广泛种植于南方地区,是重要的笋材两用竹。特别是在竹子基因功能研究技术系统中,麻竹具有比较成熟的基因过表达体系(Qiao et al. 2014; Ye et al. 2017)以及CRISPR-Cas9基因编辑技术(Ye et al. 202...