2. 目前为止,网站已经收集了人类,小鼠等9个物种的蛋白质-蛋白质相互作用关系, 搜索栏选择物种(例如:人类),输入蛋白名称(例如:gene symbol:NASP; GENE ID: 4678)进行预测。 3. 搜索结果显示该蛋白的基本信息,可能与之互作的蛋白以及这些基因的GO注释。...
1.CASTp 网址：http://sts.bioe.uic.edu/castp/ 网站打开缓慢，可预测蛋白活性位点。2.ConSurf 网...
01plant.MAP 其网站的网址：http://plants.proteincomplexes.org/，包含拟南芥、水稻、玉米等常见的模式植物的蛋白质数据。查找蛋白互作也非常简单，但是据很多同学反映，数据拟南芥的是最齐全，其他物种数据不是非常齐全，大家可以参考学习一下。操作步骤也非常简单，大家按要求输入ID名字就可以得到具体结果。02BioGRID ...
图1 是该数据库的Home界面,看图第一个红色箭头所指的区域,可以直接输入蛋白的名称点击search。 图2 是高级检索的界面,可以从图1第二个红色箭头所指的区域直接点击进去进入图2界面,把你需要查询的蛋白名称输入进去或者通过上传TXT文件点击,点击search就可以了。 图3 点击进去以后就可以进入图3界面,当然了,如果你查询...
5、CPLM和GlyStruct：这些工具专注于蛋白质糖基化位点的预测，使用深度学习模型来提高预测精度。6、MoMe...
⑦STRING：STRING是一个蛋白质互作关系数据库，整合了多种数据源的蛋白质互作信息，包括实验验证的互作、计算预测的互作和文献报道的互作。它提供了蛋白质互作网络的可视化和分析工具，用于研究蛋白质相互作用网络和功能模块。STRING: https://string-db.org/ ⑧InterPro：InterPro是一个蛋白质家族和结构域注释数据库，...
问DeepSeek
导师给了三个预测蛋白互作网站：1，Genevestigator；2，Co-AT；3， AtPIN。可是都不会用。。。有谁会...
通过R语言实现STRING数据库的高效利用，我们主要关注以下几个关键步骤。首先，展示效果，即通过差异分析结果，利用STRINGdb包挖掘蛋白相互作用关系，使用visNetwork包构建互作网络，并通过RPubs平台将网络发布至公共服务器，实现蛋白互作网络的交互式可视化。这样不仅节省了人工处理的时间，还能直观地展示蛋白质之间...
蛋白互作的网站看看这个ＳＴＲＩＮＧ数据库：https://www.omicsclass.com/article/1126 ...