根据结果,可以看到与该lncRNA结合的蛋白,依据Ranking进行排序。我们就可以选择感兴趣的进行后续分析啦 2. catRAPID express 可以预测已知RNA与蛋白的具体结合位点。具体用法同上,输入蛋白及RNA的fasta序列,提交即可。 结果如下: 以热图形式显示RNA与蛋白结合的具体位置。红色区域代表结合力较高 部分甚至还可显示具体结合...
根据结果,可以看到与该lncRNA结合的蛋白,依据Ranking进行排序。我们就可以选择感兴趣的进行后续分析啦 2. catRAPID express 可以预测已知RNA与蛋白的具体结合位点。具体用法同上,输入蛋白及RNA的fasta序列,提交即可。 结果如下: 以热图形式显示RNA与蛋白结合的具体位置。红色区域代表结合力较高 部分甚至还可显示具体结合...
catRAPID ：是⼀种⽤于估计蛋⽩质-RNA之间结合倾向的算法。通过结合⼆级结构，氢键和范德华⼒，该⽹站可以⾮常准确地预测蛋⽩质-RNA的结合。该⽹站主要包含以下6个模块 下⾯主要就⼩编使⽤过的功能给⼤家简单介绍⼀下 1. catRAPID omics 可⽤于预测与⽬的RNA结合的蛋⽩，或者...
miRDB - MicroRNA Target Prediction And Functional Study Database
如何预测microRNA与mRNA或蛋白的结合位点,软件或网站都行 miRDB - MicroRNA Target Prediction And Functional Study Database
•先驱转录因子可以招募修饰酶,调节组蛋白修饰和DNA甲基化,改变染色质构象从而调节基因转录 🌟转录因子结合位点(TFBS)是转录因子在基因组上结合的特定位置(DNA序列)。 🌟常用的转录因子结合位点分析网站:•JASPAR:收录已发表的转录因子结合位点信息•LASAGNA-Search:转录因子结合位点检索和可视化•PROMO:预测DNA...
catRAPID:是一种用于估计蛋白质-RNA之间结合倾向的算法。通过结合二级结构,氢键和范德华力,该网站可以非常准确地预测蛋白质-RNA的结合。 话不多说,上链接:http://service.tartaglialab.com/page/catrapid_group 该网站主要包含以下6个模块 下面主要就小编使用过的功能给大家简单介绍一下 ...
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