ichorCNA是一种用于估算cfDNA中肿瘤分数(类似于肿瘤组织中“肿瘤纯度”的概念)的工具。ichorCNA 使用概率模型,实现为隐马尔可夫模型(HMM),同时分割基因组,预测大规模拷贝数改变,可以估计超低通全基因组测序样本 (ULP-WGS) 的肿瘤分数。 ichorCNA 针对样本的低覆盖率 (~0.1x) 测序进行了优化,并已使用患者和健康供体 ...
HMM是一个双内嵌式随机过程,即HMM是由两个随机过程组成,其中之一是Markov链,这是基本随机过程,它描述状态的转移,另一个随机过程描述状态和观察值之间的统计对应关系。 我们考察语音,也可以发现类似的情况。语音中当前的发音音素与下一个发音音素之间以某种概率发生转移。我们听到(观察到)的只能是发音后产生的语音波形...
一种基于隐马尔可夫模型的数据采集运行异常检测方法,包括数据采集运行日志历史数据获取与数据清洗;采集流程模板建立;对每一类采集流程进行序列特征提取;根据提取的序列特征,对每一类采集流程进行隐马尔可夫模型HMM的训练;根据训练得到的HMM模型,对数据采集运行日志数据进行异常检测。数据采集运行日志数据是非结构化数据,通过简单...