组1:酿酒酵母BY4741细胞置于42摄氏度的环境中20min后,然后置于冰上冷却用于单细胞测序 组2:酿酒酵母BY4741空白对照,用于单细胞测序 组3:白色念珠菌SC5314细胞暴露于15µg/mL氟康唑3小时,在暴露前的1.5小时和3小时采集样本用于单细胞测序组4:白色念珠菌SC5314空白对照,用于单细胞测序 Part 1“酿酒酵母”单细胞...
分析酵母筛库测序结果通常包括以下几个步骤：数据预处理：使用质量控制工具（如FastQC）检查测序数据的质量。去除低质量序列和接头序列。序列比对：将清洗后的序列比对到参考基因组（如酿酒酵母的Saccharomyces cerevisiae基因组）上，通常使用比对工具如BWA或Bowtie。变异检测：使用变异检测工具（如GATK或FreeBayes...
1,第一步要将测序的文件合并成成一个文件,利用的是tbtool fasta merge and split功能,具体操作参下面的教程,一步一步截图,非常清楚。教程链接如下 https://www.jianshu.com/p/8efddabf443a 2,合并序列后,下载所测序的参考基因组序列,比如水稻全基因cds序列。我们一般熟悉LOC_Os...,所以我们要去下载参考序列。
比如,S. uvarum和S. kudriavzevii的品系就可以通过这种方式来区分。因为这两种酵母以及S. cerevisiae的微卫星区域有着不同的扩增引物,所以这个方法为我们提供了一个区分它们及其杂交品种的新途径。随着新一代测序技术的发展,我们不仅可以对酵母进行测序,还可以对其他非酵母属的物种进行测序。比如,B. bruxellensis、T. ...
来自美国国家人类基因组研究所的Meru J. Sadhu团队利用HiFi测序揭示了酵母表型多样性背后的泛基因组变异,证明了HiFi测序在识别性状变异的遗传基础方面的能力。 背景介绍 一个物种的个体成员会有无数的性状差异,包括疾病表型、农业性状、受自然选择影响的性状等等。解析遗传变异与表型变异的联系一直是遗传学研究的中心目标...
本文将为您介绍艾欧波测序技术在酵母菌表面展示中的操作步骤。 1.选择合适的表达载体和酵母菌株:根据需求选择合适的表达载体和酵母菌株。常用的表达载体包括pYD1、pYD4等,而酵母菌株常用的有Saccharomyces cerevisiae。确定表达系统后,将目标基因插入载体中。 2.转化酵母菌:将经过重组的载体导入酵母菌细胞中,可以通过酵...
此外，通过分析和 WT的转录组数据，发现SPR表达量在两个样本间存在显著差异，说明Q蛋白通过调节SPR的表达来调控SSP基因的表达，通过qRT-PCR对此进行了验证。Q等位基因对小麦性状及面包品质的影响 欢迎百度搜索欧易生物——访问欧易生物官网——了解酵母文库/酵母双杂交筛选/转录组测序技术 原创声明：本文由欧易生物(OE...
新格元推出GEXSCOPE®微生物单细胞酵母试剂盒(GEXSCOPE®Microbial Single Cell RNA Library Kit HD (Yeast)),可高通量定量酵母细胞转录本表达,用于解析酵母菌落内/间异质性。 Part3:GEXSCOPE®微生物单细胞酵母测序解决方案 GEXSCOPE®微生物...
捕手细胞 酵母衍生的生物颗粒 虽然我们谈论的目标是单细胞,但传统的单细胞技术是不够灵敏的。 大多数单细胞测序技术都是从使用孔、磁珠或液滴对单个细胞进行分区开始的。 但是,如果你正在寻找一个非常罕见的细胞群,这意味着要筛选出大量不...
红色基因组是指酿酒酵母菌株中存在的基因重组事件,使得该酿酒酵母有着不同于普通酿酒酵母的基因组。这种基因组重组的出现,尤其是在酵母等真核生物中,意义非常重大。 基因组测序分析 通过对酿酒酵母红色基因组的分析,科学家们发现了很多有趣的现象。首先,酿酒酵母的基因组大小为12兆碱基对(Mbp),其中有2.5%的基因组...