遗传图谱构建流程: ①实验设计:确定研究群体、选择遗传标记,制定实验方案; ②样本采集:收集具有代表性的亲本及子代样本,记录相关信息; ③标记检测:提取DNA,利用PCR、测序等技术检测遗传标记; ④数据整理:录入标记分型结果,建立亲本-子代遗传数据矩阵; ⑤连锁分析:运用软件进行双亲遗传分离比检验,计算重组率; ⑥图距计...
下面将详细描述遗传图谱构建的流程: 一、确定研究对象 1.1选择合适的生物群体 1.2确定研究对象的重要性和应用价值 二、选择遗传标记 2.1选择合适的遗传标记,如SNP、微卫星等 2.2确定遗传标记的代表性 三、构建连锁群体 3.1选择合适的亲本进行杂交 3.2分析后代的遗传特性,确定连锁群体 四、遗传连锁分析 4.1计算不同遗传...
具体实施方式下面结合附图对本发明的实施例进行进一步详细说明:本发明是一种高密度遗传图谱的构建方法,它包括以下步骤:1)根据遗传分离群体高通量测序数据中得到的snp标记,对标记进行基因型分型和过滤,再计算两两之间的重组率;2)利用步骤1)算得的重组率,采用分层聚类算法根据前述遗传分离群体的染色体数对snp标记进行...
本发明实施例提供的遗传分离群体的遗传图谱构建方法,首先通过对遗传分离群体的全基因组进行标记开发和分型,得到所述遗传分离群体的分子标记和所述分子标记所属的分型类型,并对所述分子标记进行连锁群划分;然后对于每一个连锁群,根据分子标记之间的重组率和所述分型类型对该连锁群内的分子标记重新分型,对重新分型得到...
基于AIO-seq高通量测序数据构建遗传群体重组断点图谱的流程软件是由中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)著作的软件著作,该软件著作登记号为:2021SR2219212,属于分类,想要查询更多关于基于AIO-seq高通量测序数据构建遗传
利用 DNA 标记构建遗传连锁图谱在原理 上与传统遗传图谱的构建是一样的。其基本步骤包括:选择适合作图的 DNA 标记;根据遗 传材料之间的 DNA 多态性,选择用于建立作图群体的亲本组合;建立具有大量 DNA 标记 处于分离状态的分离群体或衍生系; 测定作图群体中不同个体或株系的标记基因型; 对标记 基因型数据进行连锁...
本发明首次直接使用杨梅杂交种子子叶开展遗传图谱的构建,克服了杨梅杂交种子萌发困难和生长周期长的障碍,减少了杂交子代材料培育的工作量及时间,进而简化了遗传图谱构建流程。此外,以杂交f1为作图群体按“拟测交”的策略建图,符合多年生异交植物本身生长特性;再者,直接提取种子子叶中微量dna并进行多重置换扩增,即可满足常...
进一步地,根据构建的系统进化树,确定直系祖先的来源地。 进一步地,在聚类分析步骤中,根据分支聚类确定直系祖先的来源地,并通过分析系统进化树中各物种的先后顺序,确定物种之间的演化关系,从而获得群体遗传进化图谱。 应用本发明的技术方案,重组冷点区域,如着丝粒区域的序列,在进化过程中,着丝粒左右两端不发生重组的序列(...
一种拟穴青蟹高密度遗传图谱的构建方法,主要包括以下步骤: (1)作图群体构建; (2)简化基因组文库构建及高通量测序:选择最适的酶切方案,对检测合格的基因组dna分别进行酶切;对得到的酶切片段进行3’端加a处理、连接dual-index测序接头、pcr扩增、纯化、混样、切胶选取合适的目的片段,文库质检合格后用illuminahiseq...