结果展示 在转录组测序结果中,可以通过散点图对差异表达基因进行富集分析。 以KEGG通路富集结果为例,此图中,KEGG富集程度通过Rich factor、qvalue和富集到此通路上的基因个数来衡量。 富集分析 横坐标是Rich factor,为该代谢路径下差异基因数目与所有注释到该路径基因数目的比值,数值越大表示富集程度越大。 纵坐标表...
目标通路富集不显著的该如何处理? A3:首先确认差异基因的数目,如果得到的差异基因过少,很有可能导致后面的功能富集分析没有显著性结果。若是此原因可通过调整差异筛选阈值来增加差异基因的数目并重新进行差异与富集的分析(可使用NovoMagic云平台中“一键实现差异分析与富集”功能...