在进行差异基因表达分析时,得到显著差异基因后,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析, 今天就来介绍一下如何使用在线分析工具DAVID与KOBAS的进行KEGG通路富集分析…
首先,访问DAVID网站,上传基因列表,选择合适的物种,然后开始分析。在转换环节,选择ENTREZ_GENE_ID作为格式,转换完毕后,下载结果。打开Excel查看富集通路、基因及校正值,并通过网页链接获取详细信息。接着,转向KOBAS网站,选择合适的类型和物种,输入ID号。之后,选择KEGG分析并设定校正方法,开始运行分析...
选择类型,选择物种,输入ID号 选择KEGG分析 选择校正方法 开始跑 结果出来了,下载 用excel打开,可以看到富集的通路,基因,以及校正值,还有网页链接 打开链接可以看到具体的通路 好了,以上就是使用DAVID和KOBAS进行KEGG通路富集分析的操作,希望对你有所帮助。如果对操作有什么问题欢迎评论区留言讨论。