1.基因家族的基因在物种之间都是比较保守的,通过基因家族分析可以得到某物种特有的家族基因,而这些基因则有可能与该物种的特异性有关。 2. 通过对多物种构建系统发育树,从而得到物种起源进化或亲缘关系方面的信息,并为后续遗传操作提供参考。 3. 基于单拷贝基因家族,可估算出物种间的分歧时间。 4. 可以挖掘某物种...
4. 分析目标菌种的群体结构和遗传进化规律 二、 MLST与cgMLST? MLST分型技术,是一种传统的基因分型技术,利用一组7个左右的管家基因对菌株进行分型,目前pubMLST数据库中已经有鲍曼不动杆菌、气单胞菌、克雷伯菌等129种微生物的MLST数据。cgMLST,全称为全基因组多位点序列分型(CompleteGenome Multilocus SequenceTypi...
细菌基因组的结构变异分析,是分析近源基因组间或是同一物种不同菌株间,因重组、转座等机制导致的遗传基因座位变化。通过结构变异分析,可以获得菌株间基因组在进化过程中所发生结构性变异情况(染色体重排、插入、缺失),比如具有相似功能的基因簇...
选择消除分析是用来挖掘与驯化性状相关的基因。通过选择消除分析也可以定位那些我们所关注的并且与驯化相关的目标性状,并且与 GWAS 分析结果相结合,从而达到更精确的定位效果(注:只有群体存在分层的情况下,也就是该群体可以分为几个亚群,才可以做选择消除分析,...
1.基因家族的基因在物种之间都是比较保守的,通过基因家族分析可以得到某物种特有的家族基因,而这些基因则有可能与该物种的特异性有关。 2. 通过对多物种构建系统发育树,从而得到物种起源进化或亲缘关系方面的信息,并为后续遗传操作提供参考。 3. 基于单拷贝基因家族,可估算出物种间的分歧时间。
一般要进行启动子进化分析,都是在已知某一大类的基因是在CDS区比较保守 的,因此想查看在启动子区是否有同样的情况,因此首先需要对物种进行选取,以wrky家族为例,可以现在ensemble plant网站上进行预测,查看不同的物种之间的进化关系。 在搜索后,可以点击左边的基因树,查看基本的进化关系。
既然同一物种也存在高低之分，那么人族当中哪个人种最优秀呢？荷兰学者认为：从进化论的角度分析，中国人理应是世界上最聪明最优秀的人种。人种是如何进化的？从肤色进行划分的话，地球上大致分为三大人种，非洲黑种人，欧州白种人，东亚黄种人。人类的进化主要体现在脑容量的提升，这是对人种进化最直观的表现。荷兰...
在本篇综述中,我总结了识别异源多倍体亚基因组血统成分的不同方法,并讨论了这些方法的优点与不足,同时概述了使用这些方法将会对后续的基因组进化分析产生何种影响。 多倍体基因组的多样性 多倍体指的是一个生物拥有超过两套完整的染色体。然而这也可能发生在一个二倍体生物的特定细胞中,例如在特定的哺乳动物器官中,...
一、兰花的根代和进化具有不确定性 兰花中心一片叶子是丝草，本身已经属于丝草了，至于会不会根代和进化出更好的丝草，答案就具有不确定性了，这个问题涉及到“赌草”问题，赌就有运气成分在里面，不一定会进化。这位兰友是自己的草，不能说是赌草，但实际上也是在赌，赌的是运气，运气好会进化，运气不好这...
MEGA进行遗传进化分析,揭示不同种群间遗传进化关系和环境适应性机制。 MEGA 群体遗传进化分析时,我们往往会对线粒体的一些特定基因进行克隆,然后利用一代测序的方法获得这些克隆的序列信息,那么怎么对这些个体基因序列进行分析,并进行相关的群体遗传进化分析呢?MEGA能满足这一分析的绝大部需求。