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图3.3种辣椒R2R3-MYB转录因子家族的系统进化、基因外显子-内含子结构和motif分析 (A) 27个亚家族的系统进化树; (B) 27个亚家族的外显子-内含子结构(黑色方框表示外显子, 黑色线条表示内含子); (C) 27个亚家族的motif分布(不同颜色的方框表示不同的motif) Figure 3.Phylogenetic tree, gene exon-intron s...
辣椒R2R3-MYB转录因子家族的全基因组鉴定与比较进化分析
R2R3-MYB转录因子直系同源基因MYB转录因子作为植物中最大的转录因子家族之一,参与植物的生长,代谢,抵御生物和非生物胁迫等多种生理生化过程.R2R3-MYB是MYB转录因子家族的主要存在形式.辣椒是具有重要经济价值的蔬菜作物,其R2R3-MYB转录因子缺乏系统的研究.从一年生辣椒(Capsicum annuum),浆果状辣椒(C.baccatum)和中国...
R2R3-MYB是MYB转录因子家族的主要存在形式。辣椒是具有重要经济价值的蔬菜作物, 其R2R3-MYB转录因子缺乏系统的研究。从一年生辣椒(Capsicum annuum)、浆果状辣椒(C. baccatum)和中国辣椒(C. chinense)基因组中分别鉴定出94、92和94个R2R3-MYB基因, 基于系统发育关系将其分为28个亚族。共线性分析表明, 3种辣椒间...
R2R3-MYB全基因组疫霉菌MYB转录因子是植物中最大的转录因子家族之一,广泛参与多种生理生化过程.为探讨辣椒(Capsicum annuum)MYB转录因子家族功能,本研究对辣椒R2R3-MYB转录因子家族进行全基因组鉴定和生物信息学分析,并利用转录组技术检测辣椒疫霉菌(Phytophthora capsici)对该家族成员基因转录水平的影响.结果显示,辣椒...
图5.一年生辣椒(Ca)、浆果状辣椒(Cb)和中国辣椒(Cc)中R2R3-MYB转录因子的同源基因对 从外向内依次是3种辣椒的染色体数目、20 Mb窗口统计R2R3-MYB基因的数量(0-5)和3种辣椒中R2R3-MYB同源基因对。灰色线连接3种辣椒中都存在的同源基因对; 红色线连接只在两种辣椒中存在的同源基因对; 绿色线连接重复基因; 蓝...
共线性分析表明, 3种辣椒间存在73组直系同源R2R3-MYB基因, 一年生辣椒、浆果状辣椒和中国辣椒分别存在5、4和2个特有的R2R3-MYB基因。鉴定出12对重复基因, 其中8对是串联重复基因, 它们在3种辣椒分化前就已经存在。比较基因组学分析表明, 在辣椒进化过程中同源R2R3-MYB转录因子发生了功能分化。组织表达分析表明,...
比较基因组学分析表明, 在辣椒进化过程中同源 R2R3-MYB转录因子发生了功能分化.组织表达分析表明, 辣椒R2R3-MYB基因主要有3种表达特征: 在根,叶,茎和花中 均高表达, 如CaMYB13/CbMYB12/CcMYB13; 仅在花中高表达, 如CaMYB93/CbMYB86/CcMYB12; 仅在根中高表达, 如 CaMYB48/CbMYB47/CcMYB51.研究...