三、蛋白质组学:研究的主要内容和主要任务是研究细胞内所有蛋白质的组成及动态规律 蛋白质的鉴定:可以利用聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)、二维凝胶电泳、蛋白质免疫印迹分析(westernblotting)、蛋白质芯片、抗体芯片、免疫共沉淀和质谱等技术对蛋白质进行鉴定研究。蛋白质的鉴定内容包括蛋白质相对分子质量的测定、蛋白质突...
蛋白质组学分析先前揭示了NOX4敲除细胞中FAO途径的变化,对与脂肪酸(FA)分解代谢相关的不同蛋白质的独立分析发现,NOX4敲除细胞细胞中的水平升高,而NOX4过表达的细胞中的含量降低(图5C)。MYC的瞬时敲低诱导了与FA分解代谢相关的基因...
我们目前所说的转录组测序包括mRNA测序、lncRNA测序、circRNA测序、全转录组测序和单细胞转录组测序等。 蛋白质组学 蛋白质组学的概念最早是在1994年由澳大利亚学者提出,是一门研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学,是研究一个基因组、或者一个细胞、组织所表达的全部蛋白。蛋白质组学本质上指的是在...
组学研究按照分析目标不同主要分为 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学研究。基因组学研究的主要是基因组DNA,研究方法目前以 二代测序为主,将基因组拆成小片段后,再用生物信息学算法进行迭代组装。当然…
进一步对队列中治疗前的血清样本(n=41)进行了代谢组学和蛋白质组学检测,20 种基于血液的代谢物可以诊断F1、F2和F3 亚型,AUC分别为0.984、0.75和0.879(图8B)。基于血液的蛋白质组学也鉴定出了20 种亚型特异性蛋白质(图8C),其预测F1...
蛋白质组和基因组、代谢组构成了组学的基本的框架,也是肿瘤分子检测标志物的重要组成部分。本次蓝皮书连载第三篇主要介绍转录组、蛋白质组和代谢组,以及具有代表性的新型分子标志物。 《2022基因行业蓝皮书 》现已 启动合作,欢 迎联系jiyinhui_1进行洽谈。
我前面的教程:转录和蛋白水平的表达量相关性如何,解读了一个很有意思的文献, 它包含着转录组数据,蛋白质组和代谢组,而且数据是可以下载进行图表复现。恰好有学徒进行到了蛋白质组研究,还在抱怨我们《生信技能树》平台的相关教程太少了,我就趁机邀请她来做这方面知识整理,先从文献解读开始!
蛋白组：生物体基因组所编码的全套蛋白质。鉴于蛋白质表达的时空特异性，各组织器官或者特定亚细胞结构器（如线粒体、叶绿体），甚至是外泌蛋白，也可以成为一个蛋白组。所以蛋白质组是信号转导、分子发育最为直接的手段。其主要研究手段为生物质谱，在国内以牟合蛋白为典型。代谢组：生物体内源性代谢...
L02细胞TPP的肝毒性机制通过整合转录组学、蛋白组学和代谢组学的方法进行分析。结果发现TPP能够击碎膜磷脂,导致ROS产生,并且活化细胞线粒体凋亡信号通路。在多个生物学水平上,TPP能够活化促癌基因、损伤DNA、破坏氧化还原失衡以及代谢诱导肝毒性。本研究说明多组学的方法联合将提高对环境污染物的毒性途径的理解。
在本研究中,作者对用纳米CaCO3处理过的芍药(Paeonia lactifloraPall。)花序柄进行了转录组学,蛋白质组学和代谢组学分析。在对照和纳米CaCO3处理之间共检测到2643个差异表达基因(DEG)和892个差异表达蛋白质(DEP)。在892个DEP中,有152个在蛋白质组学和转录组学水平上被共调节,而与次生细胞壁相关的24个DEP参与信号...