新一代转录组测序 RNA-Seq (RNA-sequencing) RNA-Seq也称为转录组测序，是最新发展起来的利用新一代测序技术进行转录组分析的技术，可以全面快速地获得特定细胞或组织在某一状态下几乎所有转录本的序列信息和表达信息，包括编码蛋白质的mRNA和各种非编码RNA，基因选择性剪接产生的不同转录本的表达丰度等。在分析转录...
转录组测序（RNA-Seq，RNA sequencing）是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物（包括mRNA、非编码RNA等）进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络，是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
一、转录组分析有两条路1、有参考基因组的比对STAR;2、无参考基因组比对salmon;然后使用DESeq2和limma、edgeR包做差异分析source deactivate WES_analyzCNV conda deactivate WES_analyzC… 法医鉴定发表于Dr家硕的... RNA-seq入门实战(四):差异分析前的准备——数据检查 嘿嘿嘿嘿哈发表于bulk ...打开...
RNA测序(RNA- seq)是目前分析基因表达和发现新RNA物种的常用方法。可以用专门的方法来研究cDNA文库的制备解释RNA生物发生和代谢方面的问题。在本研究中,我们综述了目前用于基因表达一般分析的RNA-Seq方法和几个特定的应用,包括亚型和基因融合检测、数字基因表达谱、靶向测序和单细胞分析。此外,我们还讨论了在细胞中检测...
转录组测序 1/1 创建者:非主流音痴 收藏 转录组测序(RNA-seq)分析 11.1万播放 1、RNA-seq概论 08:10 2、RNA-seq原始数据质控 05:19 3、基因表达定量 08:00 4、差异表达分析和富集分析 08:13 5、分析实操 11:415:31:09 【生信技能树】转录组测序数据分析 生信技能树-jimmy 44.0万 2345 35:...
而RNA-seq技术则是近年来兴起的一种高通量测序技术,逐渐替代了传统的microarray技术,成为了研究转录组学的主流方法之一。 二、RNA-seq的原理 1. 测序库构建 在进行RNA-seq实验之前,首先需要构建测序库。通常采用聚合酶链式反应(PCR)或者DNA和RNA的逆转录(Reverse Transcription)来将RNA转录成双链DNA,并添加barcode...
真核无参转录组测序(RNA-seq)采用Illumina测序平台,对真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有mRNA进行测序,拼接出最长的转录本为unigene,以unigene为参考序列进行后续分析,为研究无参考基因组物种的转录水平变化提供有力的技术手段。 应用方向 无参物种基因组组装 对于无参考基因组的物种,对转录组测序数据...
ALL是儿童最常见的恶性肿瘤,占癌症的26%,转录组测序(RNA-seq)对于对于儿童ALL驱动融合基因的检测发挥了重要作用,然而,RNA-seq在表达谱、结构变异的检测的临床价值还有待研究,尤其是对传统方法未找到驱动融合基因或者难以分子分型的儿童ALL患者,下面分享一篇发表于...
总RNA适用于研究全转录组表达水平的变化,而mRNA主要用于研究特定基因的表达。 二、测序方法 RNA测序通常分为以下几个步骤: 1.文库制备:将RNA样品转录为cDNA,进行文库建立。可以使用聚合酶链反应(PCR)扩增cDNA,以增加测序信号。 2.测序平台选择:根据实验需求和预算,选择合适的测序平台,如Illumina HiSeq、Ion Torrent...