RNA-seq（RNA sequencing）即转录组测序技术，就是用高通量测序技术进行测序分析，反映出mRNA,smallRNA,noncodingRNA等或者其中一些的表达水平。在过去的十年中，RNA-Seq技术迅速发展，并成为了在转录组水平上分析差异基因表达/mRNA可变剪切的不可缺少的工具。随着下一代测序技术的发展，RNA-Seq技术应用范围变得更加广泛...
通过转录组测序,可以研究基因的表达模式、发现新的转录本、检测外显子变异、研究RNA修饰等。 转录组测序技术主要有以下几种: 1. RNA-Seq: RNA-Seq是目前最常用的转录组测序技术,它能够以高通量、高灵敏度和高分辨率分析细胞中全部转录本的表达情况。RNA-Seq首先将RNA提取、逆转录为cDNA,然后通过高通量测序仪对...
北京时间2024年9月30日晚,美国耶鲁大学樊荣团队的白志亮博士等在Cell杂志上发表了题为“Spatially exploring RNA biology in archival formalin-fixed paraffin-embedded tissues”的论文,报道了全球首个临床级FFPE样本空间全转录组测序技术—...
8月17日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所研究员陈万泽以共同第一作者身份在国际顶级期刊Nature上发表长文，介绍了研究团队在国际首创的活细胞转录组测序技术（Live-seq），该技术首次让单细胞进行转录测序后，依然能保持细胞存活，首次实现了活细胞全基因表达的连续观测。 “该研究实现了使用Live-seq技术...
这项研究开发了活细胞转录组测序技术（Live-seq），首次实现了让单细胞进行转录组测序后依然能够保持细胞存活。该技术兼具全基因表达分辨率和动态解析能力，是目前对单细胞转录组直接动态测量、偶联细胞现有状态和其后续表型的唯一解决方案。基因表达程序的变化是细胞对外源和内源刺激反应的重要表现。对单个细胞的连续观测...
2024年9月30日,耶鲁大学樊荣团队的白志亮博士等在Cell杂志上发表了题为Spatially exploring RNA biology in archival formalin-fixed paraffin-embedded tissues的论文,报道了全球首个临床级FFPE样本空间全转录组测序技术——Patho-DBiT。该平台巧妙地利用FFPE样本中自然发生的RNA片段化,向广泛多样的RNA分子原位添加poly(...
转录组测序技术流程总的来说可以分为6个部分,技术流程图如下: 接下来就给大家介绍一下各个流程的具体情况。 样本要求 建库流程 1总RNA提取 提取后的总RNA要进行纯度(purity)、浓度(quantity)、完整性(RIN)的质量检查。 不同样品的total RNA中mRNA含量差异较大,若total RNA起始投入量过低,不能保证有足够的mRNA用...
Direct RNA测序(DRS) Direct RNA测序(Direct RNA Sequencing,简称DRS)是一种利用Nanopore平台进行的转录组研究技术。这项技术能够直接读取全长转录本,无需经过反转录或扩增步骤,因此可以避免这些过程中可能产生的偏差和错误。Direct RNA测序不仅能够检测RNA分子的甲基化修饰,还能解析Poly(A)特征、m5C,假尿苷等,是一种...
01、技术原理 在这项研究中开发了一种新型的微流体空间转录组测序技术,命名为MAGIC-seq,以解决现有方法的局限性,并增强微流控技术在复杂组织中的适用性。MAGIC-seq结合了碳二亚胺化学、空间组合索引和创新的微流体设计,能够以更高的灵敏度和可重复性对多种组织类型进行分析,并提供高通量、低成本和大视野的空间转录...