有的说是2G和3G，有的说是24M，这都是指通量吗？怎么差距这么大？而且有些似乎分不清RNA-seq和全...
本文使用单核RNA测序(snRNA-seq)和空间转录组测序(Stereo-seq)研究了宫颈鳞状细胞癌(CSCC)的免疫微环境。还发现了一组促肿瘤性癌相关肌成纤维细胞(myCAFs)。myCAFs可能通过抑制淋巴细胞浸润和肿瘤细胞外基质重塑来支持肿瘤的生长和转移,与CSCC患者较低的生存率相关。这些发现增强了我们对CSCC免疫微环境的了解,可能为...
内容提示: 1 / 17 R R NA- - seq( ( 转录组学) ) 的分析流程和原理 在开始详细讲解 RNA 测序之前,我们先来了解一下它的基本步骤: 1. 建库:提取 RNA,富集 mRNA 或消除 rRNA,合成 cDNA 和构建测序文库。 2. 测序:然后在高通量平台(通常是 Illumina)上进行测序(每个样本测序reads 在 DNA 测序中,读数...
医学科研临床系统跟着18篇CNS文章学单细胞多组学分析(含空间转录组、chipseq、RNAseq、Atacseq和外显子医学会员免费学 0 0 2023-04-13 21:55:40 未经作者授权,禁止转载 您当前的浏览器不支持 HTML5 播放器 请更换浏览器再试试哦~点赞投币收藏分享学习...
为了纠正批次效应,作者将scRNA-seq数据与Seurat整合方法进行整合。在此基础上,采用统一流形逼近投影(UMAP)嵌入空间和基于图的聚类方法对细胞簇进行识别。用众所周知的标记对聚类进行注释。细胞分为16种主要细胞类型(图1C-E),包括以Cd79A、Cd79B和Ms4a1为标记的B细胞,以Ncr1、Klrb1c和Nkg7为标记的NKs,以C1qb、...
课程亮点 1.对RNA- seq数据分析全流程进行详细解析,经过4个课时的实操教学,可以熟练掌握RNA- seq数据分析技术。主讲教师具有超过8年生信分析实战经验。课程从基础理论讲解到与实际操作相结合, 轻松掌握! 查看更多 购买课程 (￥40/共5集) 爱奇艺努力加载中... ...
为了了解这一差距,本研究分离到CAF,并对细胞进行转录组分析,以根据其基因表达谱验证它们是不是CAF,并通过单细胞RNA测序技术(scRNA-Seq)和空间转录组(ST)技术鉴定这些细胞,从而确定了CAF对GBM及微环境的影响。 主要技术 空间转录组学;单细胞RNA测序 研究结果 1. 单细胞测序鉴定连续胰蛋白酶消化的GBM样本存在CAF ...
我们首先利用结合scRNA-seq数据的空间转录组学技术展示了子宫腺肌症的整体景观。在腺肌病变中,上皮细胞被基质细胞包围,与异位子宫内膜相比,异位病变表现出STEAP4+血管周围细胞(PV STEAP4)的富集,这表明血管生成微环境可能有助于子宫腺肌症的进展(图2A)。然后,将上皮细胞分为纤毛细胞亚组和非纤毛细胞亚组(图2B)...
单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 技术使科学家能够详细分析单个细胞的基因表达情况,从而揭示细胞在不同状态下的动态变化。然而,由于测序过程会破坏细胞,导致无法追踪同一细胞在不同时间点的变化,这给研究细胞的成长轨迹和动态过程带来了挑战。 为了解决这一难题,Nature Machine Intelligence 近期发表的一项研究介绍了一种名为...
作者首先通过结合scRNA-seq数据的空间转录组技术显示了子宫腺肌症的总体情况。在子宫腺肌症病变中,上皮细胞被基质细胞包围,与在位子宫内膜相比,异位病变表现出STEAP4+血管周细胞(PV STEAP4)的富集,这表明血管生成微环境可能有助于子宫腺肌症的进展(图2A)。