总而言之,在经过对DEGs和KEGG通路富集的综合分析之后,转录组单组学分析结果表明,FOXO1蛋白在脂质合成代谢中有显著影响。 图2. 转录组单组学分析结果(A、C、E、F由Omicsmart绘制):PCA分析(A);差异分析(B);差异聚类热图分析(C);GO富集分析(D、E);KEGG富集分析(F) 2. 代谢组单组学分析 在代谢组检测结果中,...
而代谢组分析可以用来研究物种代谢产物的最终组成,进一步可以对物种表型和生物功能产生重要影响。通过将转录组和代谢组两种技术结合在一起进行分析,可以更好地解释基因表达水平和细胞功能的关联,从而更好地解释生物活性。 此外,转录组和代谢组关联分析也可以用来研究某一疾病中的复杂网络机制,帮助我们理解特定疾病是如何...
在进行转录组学和代谢组学的关联分析时，通常首先收集同时进行转录组和代谢组测序的样本数据。转录组数据可以提供关于基因表达的信息，而代谢组数据则提供了关于生物体内小分子代谢产物的信息。通过比较不同条件或状态下转录组和代谢组的变化，可以识别出两者之间的关联性。分析方法可以包括相关性和回归分析、...
近些年来,转录组和代谢组关联分析已成为探讨研究和临床疾病及其生物学机制方面的一个新兴研究领域。这是一个比较新的和复杂的领域,随着技术的发展和深入,它也不断改变着今天的生物科学研究和临床实践。 转录组和代谢组之间存在显著的关联,这种关联可以使我们更好地了解细胞的活动,从而提供有关健康和疾病的信息。该...
其中转录组(Tranome)反应了基因表达的动态变化;代谢组(Metabolome)可以获取到样本中成百上千的在生命活动变化或外界刺激下的关键代谢物响应情况,二者关联研究,能够同时整合基因型和表型的数据,为目标性状的复杂生物学调控提供重要信息,这也是目前最常用的研究方案。
CCA）：这是一种多变量统计分析方法，可以用来分析两组数据（如代谢组数据和转录组数据）之间的关联性...
代谢组学分析通常使用质谱仪进行,这是一种可以同时检测多种小分子化合物的设备。与此同时,转录组学研究通常使用RNA测序技术,这是可以同时检测上万个基因表达水平的一种方法。 这些技术的发展使研究者可以更加深入地了解代谢组和转录组的关联关系。一些先前的研究已经证实,代谢组和转录组之间有很多相互作用。比如,细胞...
(54)发明名称一种转录组和代谢组数据关联分析方法及系统(57)摘要本发明公开了一种转录组和代谢组数据关联分析方法及系统,所述方法包括如下步骤:步骤S1,对样本进行转录组测序,并对转录组数据进行生物信息分析,获得差异表达基因;步骤S2,对样本进行代谢组测序,并对代谢组数据进行生物信息分析,获得差异代谢物;步骤S3,...
本发明涉及转录组学和代谢组学技术领域,特别是涉及一种基于生物信息算法组合的转录组和代谢组数据关联分析方法及系统。 背景技术: 代谢组是系统生物学的重要组成部分,是生命活动的最终产物,直接体现了环境变化或生理病理变化给机体带来的影响,转录组测序可以得到大量差异表达基因和调控代谢通路,但生物系统中转录与代谢并不...
转录组与代谢组联合分析中,基于相关性系数(PCC),WGCNA,K-means等聚类分析,挖掘到4个可能的高钙响应通路:1)钙信号转导途径:根据ICP-MS检测比较不同处理下植株中Ca~(2+),Mn~(2+)等离子的含量,结果发现随着Ca~(2+)处理浓度的升高YW幼苗的Ca~(2+)含量随之增加,而Mn~(2+)含量则相反.钙调素蛋白(CML)在...