文章《Comparative tranome and metabolome profiling reveal molecular mechanisms underlying OsDRAP1-mediated salt tolerance in rice》中作者基于转录组和代谢组结合过表达基因OsDRAP1研究水稻耐盐,其中联合分析使用的方法便是计算代谢物与基因之间的皮尔逊相关性系数及P值,结合通路发现氨基酸和碳水化合物代谢途径在OsDRAP...
前期介绍了 代谢组与微生物联合分析的方法(点击回顾) , 这次将介绍代谢与转录组联合分析的常用方法,主要包括相关性分析、KEGG通路分析、典型相关性分析等,这里相关性分析是两两代谢物表或者基因表达量之间计算相关性,典型相关是多变量多个代谢物和多个基因一起的两组数据进行降维,可类比于PCA。下面将用一些实际案例来...