可分为ONT isoform定量全长转录组（ONT iso-seq）和ONT poly(A)-isoform定量全长转录组（ONT poly(A...
RNA-seq:RNA-seq是一种第二代测序技术,主要包括Illumina HiSeq和NextSeq等。RNA-seq通过将RNA反转录成cDNA,然后进行扩增和测序,获取RNA的片段序列信息。 2.应用范围: 三代全长转录组测序:由于可以直接测序RNA的全长,三代测序技术在研究转录本的全长变异、剪接异构体和RNA修饰等方面具有优势。它可以提供更全面和准...
转录组分析的研究方法,研究平台发生着日新月异的变化,同时生物信息学分析的 内容也在逐渐完善.RNA-Seq 作为一种新的转录组研究手段,利用新一代测序技术能够更为快速,准确地为人们提供更多的生物 体转录信息.主要比较近年来转录组研究的几种方法和几种 RNA-Seq 的研究平台,并着重介绍 RNA-Seq 的原理,用途,步骤...
三代全长转录组测序与RNA-seq 在技术原理和数据类型上有显著区别。RNA-seq 通常采用二代测序技术(如 Illumina),生成短序列片段,需要拼接和基因注释来重构转录本,而三代全长转录组测序使用第三代技术(如 PacBio 或 Oxford Nanopore),能够直接测序较长的 RNA 分子,获得完整的转录本。由于三代测序直接提供完整的转...
近年来,随着生物学研究的深入和技术的发展,RNA测序(RNA-Seq)和转录组分析技术成为了生命科学领域中最受关注的研究手段之一。通过RNA测序和转录组分析,研究人员能够全面了解基因的表达情况和调控机制,从而深入研究生物体的发育、疾病机制、细胞信号传导以及环境应答等方面。本文将对RNA测序技术、转录组分析技术以及其应用领...
全转录组测序(Total RNA-Seq) 项目介绍 全转录组是指特定细胞在特定状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(non-coding RNA)。针对非编码RNA的研究主要集中在具有调控作用的miRNA,lncRNA和circRNA。 基于二代测序技术的全转录组测序研究,同时分析同一样本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA,并且通过关联...
1. 文章的单细胞数量不多,12222个细胞研究了棉花色素腺的形成和发育,并且发表在了Molecular Plant上,其文章特色是每一步都结合了bulk RNA-seq在萌发不同时期的表达模式,进一步证实了scRNA-seq挖掘结果的准确性,是一篇非常好的非模式植物单细胞+普通转录组的经典案例。
技术路线: 主要结果: 1. IC膀胱CD45+免疫细胞的单细胞转录谱 为了破译和构建IC的免疫图谱,作者使用scRNA-seq来检测IC和健康志愿者膀胱的转录组异质性(图1a)。病理特征显示IC膀胱较对照组:尿路上皮剥蚀或解剖丧失、血管生成、免疫细胞浸润(图1b)。IC患者和对照组的膀胱标本新鲜采集,解剖,消化成单个细胞,共分离出...
有参常规转录组(RNA-Seq) 转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有RNA,可从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理,广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。同时,还能发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点以及cSNP(编码序列单核苷酸多态性),提供最全...