其中,转录因子(transcription factor,TF)对基因的转录调控是很重要的一环。 前期直播时,我们已经介绍了转录因子的基本概念与结构,转录因子基于其特有的DNA结合结构域(DNA Binding Domain,DBD)与靶基因的启动子区进行结合,随后利用转录活化模块(Trans-Activation Domain,TAD)调控转录。许多老师在做完测序研究(如ChIP-seq)...
作者通过ATAC-seq绘制了胶质母细胞瘤干细胞(GSC)和神经干细胞(NSPC)的全基因组染色质开放区域图谱,并结合转录组测序数据发现了在肿瘤细胞迁移中起关键作用的转录因子TEAD1,并通过细胞和异种移植模型水平上的TEAD1的敲除与过表达的体内外功能验证实验,验证了TEAD1促进迁移的功能性作用。 作者通过ATAC-seq和转录组测序...
转录因子的调控机制包括两个方面:一是转录因子的表达量和活性的调控,二是转录因子与DNA序列的结合选择性。在细胞内,转录因子的表达量和活性受到多种因素的影响,如细胞信号通路的激活、蛋白质修饰等。转录因子和DNA序列的结合选择性也是由多种因素决定的,如转录因子的结构、DNA序列的特异性等。转录因子的调控机制对于...
["1、基础转录因子识别不同的启动子并决定转录的起点与方向,维持基础水平的转录;2、结合于启动子上游调控元件的上游转录因子负责调控基因的基础转录频率;3、中介因子在基因的转录调控中具有不可替代的“桥梁”作用;4、基因特异性转录因子对基因的转录进行精细调控;5、转录因子能够接受上游调控信号进行级联调控。基因表达...
在此,作者从人GBM和生发层(GM)组织中直接分离出GSC和神经干细胞/祖细胞(NSPC),基于ATAC-seq研究在相似的发育背景下肿瘤发生的内在转录调控因子及其调控机制。 研究方法 ATAC-seq 通过荧光激活细胞分选术(FACS)从GM和GBM组织中分离的细胞GSC(EGF+/-)、NSPC(EGF+/-),分别进行ATAC-seq。
转录因子EB(transcription factor EB,TFEB)是碱性螺旋-环-螺旋黑素细胞诱导转录因子(melanocyte inducible transcription factor,MITF)或转录因子增强子家族(transcription factor enhancer family,TFE)成员,具有影响溶酶体功能和细胞自噬等功能.TFEB的转录活性主要受磷酸化及去磷酸化修饰的影响,且和其亚细胞定位有着密切的...
山东大学丁兆军团队在Molecular Plant在线发表了题为NAC1 regulates root ground tissue maturation through coordinating with SCR/SHR–CYCD6;1 module in Arabidopsis的研究论文。该研究揭示了拟南芥NAC转录因子家族成员NAC1协同SHR/SCR-CYCD6;1模块调控植物根基本组织成熟（root ground tissue maturation）的分子机制。
在此基础上,研究者确定了四个介导肿瘤细胞特异性调节机制且具有预后价值的关键转录因子(transcript factors, TFs)(HOXC5、VENTX、ISL1和OTP)。在后续实验中,研究者发现靶向上述转录因子可以减少肿瘤细胞的增殖。与此同时,多组学联合分析...
1.2 转录因子的分类 转录因子可以根据其结构域和功能进行分类。常见的转录因子家族包括AP2/ERF家族、bZIP家族、WRKY家族、MYB家族等。每个家族的转录因子都有其特定的DNA结合模式和调控特性。 二、转录因子在植物抗逆性中的调控机制 植物在逆境条件下,转录因子通过多种机制调控基因表达,以应对不同的环境压力。 2.1 逆境...
- 在M期,转录因子如FOXM1,参与调控细胞分裂过程中的基因表达。 三、转录因子在细胞周期调控中的具体作用机制 转录因子通过多种机制参与细胞周期的调控,包括直接结合DNA、与共激活因子或共抑制因子相互作用、以及通过表观遗传修饰影响基因表达等。 3.1 转录因子与DNA的直接结合 转录因子通过其特定的DNA结合域与基因启动...