个转录因子,分属 58 个家族.对预测到的转录因子,从家 族和个体两个层次进行了详尽注释,构建了植物转录因子数据库 PlantTFDB(http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn).PlantTFDB 提供了覆 盖绿色植物主要谱系的转录因子,其中大部分为具有重要经济价值的单子叶和双子叶植物,已成为植物转录因子功能和演化研究 的重要信息...
植物转录因子分类、预测和数据库构建 下载积分: 1500 内容提示: ·特约综述· 2015, 31(11):68-77生物技术通报BIOTECHNOLOGY BULLETIN基因表达调控在动植物生长发育过程中具有重要作用,是植物适应外界环境的分子基础,转录调控是基因表达调控的关键步骤。转录调控通过转录因子(Transcription factor)蛋白质序列中的 DNA 结合...
hmmemit: 从HMM模型中,得到一个模式序列; hmmfetch: 通过名字或者接受号从HMM库中取回一个HMM模型; hmmpress:格式化HMM数据库,以便于hmmscan搜索使用; hmmstat: 显示HMM数据库的统计信息 重要的问题说一遍 注意每个程序都是输出文件在前面,输入文件在后面 hmmbuild (建立参考数据的隐马尔可科夫模型) hmmbuild hd.h...
通过深入全面的文献调研 ,总结了一套完整的植物转录因子家族分类规则 ,开发了转录因子预测流程 ,构建 了转录因子预测平台 。基于该流程 ,从 83 种绿色植物中预测到 129 288 个转录因子 ,分属 58 个家族 。对预测到的转录因子 ,从家 族和个体两个层次进行了详尽注释 ,构建了植物转录因子数据库 PlantTFDB (。