细胞分化是多细胞生物发育过程中至关重要的生物学过程,其中先锋转录因子通过调控染色质可及性,为特定基因表达奠定基础,从而影响细胞命运的走向。传统观点认为,先锋因子的功能主要由其自身结构特性决定。本研究则提出,转录因子的表达时序同样...
2023年12月15日,清华大学生命学院颉伟研究组在Science期刊上以长文形式发表了题为Multifaceted SOX2-chromatin interaction underpins pluripotency progression in early embryos的研究论文,报道了多能性先锋因子SOX2在哺乳动物早期胚胎多能性建立和转换过程中的调控机制。这一研究发现早期胚胎中SOX2与染色质并非简单通过先锋...
先锋转录因子(pioneer transcription factor)是一类可以结合特异DNA序列的转录因子,它们可以识别核小体上的特异DNA序列,并招募染色质重塑复合体(chromatin remodeler)来移除核小体,形成缺乏核小体的染色质可及区域,引发一系列反应,包括组蛋白修饰、转录起始...
转录因子(Transcription Factors, TFs)具有识别特定DNA序列并调控转录的功能。由于DNA通常被组装在核小体中,导致TFs的结合位点被隐藏而不能被TFs识别并结合。科学家们发现有一小部分被称为先锋转录因子(Pioneer TFs)的蛋白可以结合被压缩在核小体内的DNA序列,先锋TFs通过增加染色质可及性促进其他TFs的结合【1】。
研究发现CTCF与谱系特异性先驱转录因子合作,包括MyoD、FOXA 和 PU.1,在1D和3D水平上控制细胞身份。在1D水平上,先驱转录因子通过开放染色质促进谱系特异性CTCF的结合。在3D水平上,CTCF和先锋转录因子形成调控中心来控制细胞身份基因的表达。上述机制已使用MyoD缺失小鼠、CTCF敲除小鼠和生肌分化过程中的CRISPR编辑进行了...
先锋转录因子是一类关键性的转录因子,它们在基因表达调控中发挥着至关重要的作用。转录因子是一类能够结合到DNA上的蛋白质,通过调控基因转录的过程来控制基因表达。而先锋转录因子则是一类在细胞内特定环境条件下,以无需前期基因表达的方式,直接作用于染色质并展开调控活性的转录因子。 先锋转录因子的特殊作用机制和广泛...
DNA包装成核小体包装可以从物理上阻止调节基因表达的转录因子进入它们的结合位点。限制对DNA的访问是转录调节方式的一个组成部分。然而,先锋转录因子甚至可以在包裹的染色质内与它们的目标DNA片段结合,而且也被认为可以促进其他转录因子的结合。转录出现差错与许多癌症有关,因此对这一过程更详细的了解可能有助于开发未来...
他们的研究聚焦在一组“先锋转录因子(pioneer transcription factors,pTF)”上。这些蛋白质与染色质内的特定DNA区域结合,启动染色质重塑并控制下游因子的招募,但这些区域本身被其他蛋白所掩盖。那么,先锋转录因子是如何玩转染色质迷宫的呢? Rap1接触染色质的示意图 ...
在果蝇中,先驱转录因子ZLD在ZGA期间发挥着关键作用。ZLD表现出先锋TF的几个关键特征,包括(1)与核小体DNA的结合;(2)调节早期合子基因的转录;(3)调节染色质易接近性以增加其他非先锋TF与DNA结合的能力。然而,大部分ZLD结合位点(60%)高度聚集在富含GA的基序,并且即使在没有ZLD的情况下也具有组成性开放染色质...
新的研究发现被称为先锋转录因子蛋白是可以帮助启动赋予细胞独特特性和功能的关键基因。 研究表明,先锋转录因子有助于解开紧密缠绕的线圈DNA,从而可以读取基因中的基因蓝图,并制造出在生物过程中发挥作用的蛋白质。 2020年12月10日,《基因与发育》杂志发表了关于果蝇“先锋转录因子GAF与PBAP(SWI/SNF)、NURF(ISWI)协同...