基因转录是在细胞核和细胞质内进行的。它是指以DNA的一条链为模板，按照碱基互补配对原则，在RNA聚合酶作用下合成RNA的过程。基因转录有正调控和负调控之分。如细菌基因的负调控机制是当一种阻遏蛋白(repressor protein)结合在受调控的基因上时，基因不表达；而从靶基因上去除阻遏蛋白后，RNA聚合酶识别受调控基因的...
细胞内的mRNA反转录成cDNA,然后对所得的cDNA进行高通量测序,产生大量的序列数据(reads)。这些reads通过与参考基因组进行比对或从头组装,最终得到转录组的信息,包括基因的表达水平、转录本的剪接方式、新转录本的发现等。 测序分类有参转录组测序:通过将测序数据与参考基因组进行mapping得到转录本信息,对转录本进行功能注...
转录就是以DNA为模板的RNA的酶促合成,RNA合成的方向总是固定的,即是从RNA分子的5’→3’。通常两条DNA链中只有一条会转录成RNA。原核生物转录的过程如下: (1)转录起始 原核生物转录的起始包括RNA聚合酶辨认转录起始点并与之结合,DNA双链局部解开,形成...
(一)转录过程 1.转录起始 基因的转录是由RNA聚合酶催化进行的。基因的上游具有结合RNA聚合酶的区域,叫作启动子。启动子是一段具有特定序列的DNA,具有和RNA聚合酶特异性结合的位点,决定了基因转录的起始位点。RNA聚合酶与启动子结合后,在特定区域将DNA双螺旋两条链...
转录组是指一个细胞、组织或生物体在特定条件或状态下转录的所有RNA集合。RNA-Seq利用新一代测序技术，通过测序细胞或组织中的所有RNA，分析其种类和丰度，从而获得基因表达的全景图。转录组测序的主要步骤包括：RNA提取、构建文库、测序和数据分析。二、转录组测序的主要步骤 RNA提取：从样本（如细胞、组织、血液等）...
现阶段转录组学研究主要依靠高通量测序技术。对于非模式生物来说，大多数植物的基因组信息较为匮乏，而转录组的优势在于即使在没有参考基因组的情况下也可以进行。另外，高通量测序获得的数据基本可以覆盖全部表达的基因，这对于挖掘功能基因是十分有利的。2.转录组在植物研究中的应用，有哪些？转录组测序技术是目前在...
转录组（transcriptome）广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合，包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA；狭义上指所有mRNA的集合。对象 转录组测序一般是对用多聚胸腺嘧啶（oligo-dT）进行亲和纯化的RNA聚合酶II转录生成的成熟mRNA和ncRNA进行高通量测序。优势 相对于传统的芯片杂交平台，转录组测序无...
1 DNA复制优先在转录起始位点启动 为了研究人类细胞中的复制起始和终止,我们对(人端粒酶逆转录酶插入)永生化视网膜色素上皮细胞进行了Ok-seq。先前对哺乳动物DNA复制的全基因组研究表明,复制起始的一致性有限,但所有发现的复制起始都与转录基因接近显着富集。所以本文的分析重点是在转录区域中复制启动和终止的效率上。A...
DNA 复制和转录发⽣在⽣命各个领域的所有活细胞中。这两个基本过程同时发⽣在同⼀模板上,导致执⾏这些功能的⼤分⼦机器之间发⽣冲突。过去几十年的⼤量研究表明,这在原核和真核细胞中都是不可避免的问题。我们已经知道,冲突会导致复制叉逆转、DNA 断裂、R-loop 形成、拓扑应力和突变,最终会影响进...