样本可以来自裂解的单细胞或bulk RNA；RNA分子经过oligo-dT 引物的反转录后，RNA/DNA杂合链可直接被Tn5转座酶打断（图中灰色的波浪线及直线分别代表RNA及DNA分子）；在Tagmentation之后，转座酶会在杂合链两端加上adapter接头，进行之后的建库PCR扩增。图1. SHERRY转录组测序建库流程。图片来源于：https://mp.weixin....
Tn5转座酶除了能够切割双链DNA之外,还能够切割DNA/RNA杂交链。 基于此原理,北京大学的黄岩谊课题组和谢晓亮课题组联合清华大学王建斌课题组,在美国《国家科学院院刊》(PNAS) 上发表的文章介绍了一种新的基于Tn5转座酶的转录组测序快速建库...
SHERRY技术思路 样本可以来自裂解的单细胞或bulk RNA;RNA分子经过oligo-dT 引物的反转录后,RNA/DNA杂合链可直接被Tn5转座酶打断(图中灰色的波浪线及直线分别代表RNA及DNA分子);在Tagmentation之后,转座酶会在杂合链两端加上adapter接头,进行之后的建库PCR扩增。 图1. SHERRY转录组测序建库流程。图片来源于:https://m...
Tn5转座酶建库原理.pptx,Tn5转座酶建库原理Tn5转座酶是一种强大的工具,用于构建用于下一代测序(NGS)的DNA文库。 它通过在基因组DNA中插入接头序列来实现这一目标。hdby h d Tn5转座酶的结构和功能结构Tn5转座酶是一个由两个亚基组成的蛋白质,每个亚基都包含一个 DNA 结
Tn5转座酶建库原理.pptx,Tn5转座酶建库原理作者: Tn5转座酶简介Tn5是一种转座酶,能够将DNA片段插入到目标基因组中。Tn5转座酶广泛应用于二代测序文库构建中。Tn5转座酶是近年来基因组研究的重要工具。 Tn5转座酶的结构特点DNA 结合域Tn5 转座酶包含一个高度保守的 DNA 结
传统建库方式需要经过DNA片段化、末端修复、接头连接、文库扩增、多次纯化分选等步骤,耗时较长,将Tn5用于测序文库构建时,可将DNA片段化、末端修复、接头连接等多步反应转变为1步反应,极大缩短建库时间,提高工作效率。 研究发现,Tn5转座酶可以仅识别OE序列并将其随机插入DNA中,完成体外的转座。根据这一原理,将测序的P5...
样本可以来自裂解的单细胞或bulk RNA;RNA分子经过oligo-dT 引物的反转录后,RNA/DNA杂合链可直接被Tn5转座酶打断(图中灰色的波浪线及直线分别代表RNA及DNA分子);在Tagmentation之后,转座酶会在杂合链两端加上adapter接头,进行之后的建库PCR扩增。 图1. SHERRY转录组测序建库流程。图片来源于:https://mp.weixin.qq....
在1月27日,由北京大学的黄岩谊课题组和谢晓亮课题组联合清华大学王建斌课题组合作完成,开发了一种新的基于Tn5转座酶的转录组测序快速建库方法,以红酒的名字来命名,并起名为SHERRY(Sequencing HEteRo RNA-DNA-hYbrid )。与已有的转录组测序相比,不需要cDNA二链合成,大大简化了建库的过程 ;而且只需要微量的样本就可以,...
Tn5转座酶建库原理
Tn5 引爆极速建库和长片段之战近 10 年间,NGS(Next Generation Sequencing)技术高速发展,测序仪器不断更新迭代,形成规模化。在测序模式产业化的大环境下,测序样本制备成为其中很重要的一环。样本起始量要求过高、建库流程繁琐等都会限制 NGS 技术的 应用。科学家们一直在不断探索,试图突破此类限制,其中转座酶(...