2025 年 1 月 23 日,中国科学院动物研究所赵方庆团队在国际顶尖学术期刊 Cell 上发表了题为:High-resolution spatially resolved proteomics of complex tissues based on microfluidics and transfer learning 的研究论文。该研究提出了全新的...
“相比现有技术,MAGIC-seq显著提升了检测通量,大幅降低了芯片成本和批次效应,同时兼顾了高分辨率和大面积捕获区域,为大规模和复杂组织研究提供了新的可能性。”赵方庆告诉《中国科学报》。 “单组合,多点标记” 近年来,空间转录组学作为一种能够...
2024年10月23日,中国科学院动物研究所赵方庆团队在Nature Cell Biology发表了题为Real-time and programmable transcriptome sequencing with PROFIT-seq的研究论文,介绍了他们开发的全转录组可编程智能测序新技术PROFIT-seq。该技术首次将全转录组捕获技术与计算机编程实时操控算法相结合,能够在测序过程中同时进行分析和富集...
动物研究所赵方庆研究组现因科研工作需要,拟招聘副研究员岗位人员1名。 一、岗位职责 (一)在研究组长的指导下承担科研任务,完成课题研究; (二)协助指导研究生开展相关工作,提供专业知识和技术支持; (三)协助研究组长进行实验室日常管理工作。 二、应聘条件 (一)具有基因组学、生物信息学、微生物学等相关领域博士学...
《自然—计算科学》:赵方庆团队开发新算法集成大规模微生物组数据精准识别疾病标志物 近年来,肠道菌群与人体健康和疾病关系的研究越发丰富,尤其是随着测序技术、基因组研究等的发展,大量的研究为该领域积累了海量的生物数据信息。如何从海量零散的数据中,挖掘出与人类健康和疾病紧密相关的信息,成为肠道菌群领域关注的首要...
2022年6月10日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在国际期刊Nature Communications上发表了题为“Exploring the cellular landscape of circular RNAs using full-length single-cell RNA sequencing”的研究论文。该研究基于海量单细胞全长转录组测序数据集,实现了单细胞分辨率下环形RNA的高效识别及深度挖掘,基于大规...
近日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员团队与海军军医大学第二附属医院(上海长征医院)生殖医学中心孙宁霞主任团队合作在Science Bulletin发表题为“Spatiotemporal patterns of the pregnancy microbiome and links to reproductive disorders”的封面文章。该研究通过系统整合和深度挖掘超过10000例妊娠期女性微生物样本,...
国家微生物科学数据中心特别邀请我国微生物组学技术及大数据领域十位名师,推出网络系列精品课程,本期邀请中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员分享《微生物组:金矿还是泡沫》。本课程从微生物组发展现状,菌群作用的争议等角度讲解微生物组研究存在的问题和发展机遇,解析微生物组引发争议的原因,目前团队研究的工作包括如...
军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所曹务春团队与中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队合作,首次报道了我国6大广布蜱种的高质量基因组,包括全沟硬蜱( Ixodes persulcatus )、长角血蜱( Haemaphysalis longicornis )、森林革蜱( Dermacentor silvarum )、亚洲璃眼蜱( Hyalomma asiaticum )、血红扇头蜱( Rhip...
赵方庆研究表示,相比现有技术,MAGIC-seq显著提升了检测通量,大幅降低了芯片成本和批次效应,同时兼顾了高分辨率和大面积捕获区域,为大规模和复杂组织研究提供了新的可能性。 “单组合,多点标记” 近年来,空间转录组学作为一种能够在组织原位解析基因表达的技术,在揭示组织细胞组成、空间异质性和复杂的细胞间互作关系方面...