赖氨酸-2-羟基异丁酰化(Khib)是近年来在真核和原核细胞组蛋白上报道的一种新型翻译后修饰,参与转录、细胞代谢等重要生命活动。在真菌中Khib修饰的功能研究鲜有报道,前人仅在酿酒酵母中揭示了介导组蛋白H4K8的Khib水平调控的关键环境因子和...
赖氨酸2-羟基异丁酰化(Khib) 是近年来在真核细胞中发现的一种新型组蛋白翻译后修饰 (PTM) ,已被证明能够参与转录、细胞代谢等重要生命活动[1]。2018年天津医科大学基础医学院张锴教授课题组报道了Khib在原核细胞广泛分布[2]。随后张锴教授课题组进一步研究发现CobB作为一种Khib去修饰酶,介导Khib调节代谢酶活性,改变...
赖氨酸-2-羟基异丁酰化(K hib )是近年来在真核和原核细胞组蛋白上报道的一种新型翻译后修饰,参与转录、细胞代谢等重要生命活动。在真菌中K hib 修饰的功能研究鲜有报道,前人仅在酿酒酵母中揭示了介导组蛋白H4K8的K hib 水平调控的关键环境因子和去修饰酶,而对K hib 在植物病原真菌致病中的作用及其调控机制还...
而CobB是已知的去乙酰化酶,由此作者提出假设CobB可能具有去除赖氨酸-2-羟基异丁酰化的作用。 作者通过对体内CobB敲除和过表达体系中Khib水平的检测等实验,证实了CobB是Khib的去修饰酶,同时表征了其结合力和酶动力学规律,并进一步确定了R...
该项研究作为原核生物奇异变形杆菌中第一个非组蛋白2-羟基异丁酰化修饰图谱鉴定,该修饰在细菌中的后续功能研究提供了新的思路。 综上所述,蛋白质赖氨酸酰化修饰广泛存在于真核与原核生物中,并且参与到以能量代谢为主的多种生理生化过程,越来越多的文章揭示并证明了酰化修饰的关键性与广泛性。而“应用蛋白质谱分析...
例如,乙酸和琥珀酸分别是赖氨酸乙酰化(Kac)和赖氨酸琥珀酰化修饰(Ksucc)的前体,同时乙酰辅酶A与琥珀酰辅酶A也是赖氨酸甲基化的辅助因子[2, 3]。这些修饰可以通过酶促或自发的化学反应形成,表明细胞代谢与蛋白质修饰之间存在着紧密联系。近年来,越来越多的赖氨酸酰化修饰被发现,如赖氨酸2-羟基异丁酰化(Khib)和...
例如,乙酸和琥珀酸分别是赖氨酸乙酰化(Kac)和赖氨酸琥珀酰化修饰(Ksucc)的前体,同时乙酰辅酶A与琥珀酰辅酶A也是赖氨酸甲基化的辅助因子[2, 3]。这些修饰可以通过酶促或自发的化学反应形成,表明细胞代谢与蛋白质修饰之间存在着紧密联系。近年来,越来越多的赖氨酸酰化修饰被发现,如赖氨酸2-羟基异丁酰化(Khib)和...
列特征,开发出预测模型iLys-Khib,用于预测赖氨酸2-羟基异丁酰化位点。Zhang [17] 等开发出kmal-sp预测工具对赖氨酸丙二酰化位点进行预测。该方法基于蛋白 质序列和氨基酸理化性质设计11种不同的特征编码方式,并采用LightGBM、 随机森林、支持向量机、K-近邻以及逻辑回归算法,对大肠杆菌、家鼠和智人这 三个物种的...
而近期发现的新型赖氨酸酰基化修饰模式包括丙二酰化、丁二酰化、戊二酰化、β-羟基丁酰化等却几无生物功能的研究。对这些修饰后的赖氨酸进行深入的生物功能研究需要足够的均质的翻译修饰后蛋白。目前对含有特定翻译后修饰的均质蛋白的制备与纯化却是个难题[3]。虽然化学生物学家也发展了多种制备方法,不过目前已有的...