SCENIC可以识别Regulon调控子以及每个细胞的Regulon活性得分(RAS, regulon activity score);通过计算Regulon特异性得分(RSS, Regulon specificity score)获取Regulon与每种细胞类型的特定对应关系;利用Regulon的关联特异性指数(CSI, connection specificity index)表示不同Regulon之间的关联性,同时具有较高CSI的Regulon可能共同调...
调节中介作用同时考虑中介作用和调节作用,核心是中介作用,并在中介作用的基础上进一步讨论调节作用。📈 验证性因子分析 验证性因子分析(CFA)是使用样本数据验证已经根据某些理论、先验知识作出的结构模型(测量因子与测量题项之间的关系)是否与研究者预测保持一致的过程。📊 路径分析 路径分析由回归分析发展而来,用于研究...
自2019年第一篇纯生信分析整体m6A regulators在泛癌水平的分子/临床特征以后(PMID:31521193),多个课题组开始以整体m6A regulators为研究对象,按照高度相似的技术路线,在不同癌种中进行相对深入的分析。此类研究全面揭示了m6A regulators在不同癌种中的失调图谱,解析了其与癌症相关核心通路及肿瘤微环境(TME)之间的潜在...
MTX的作用原理是抑制二氢叶酸还原酶从而阻断叶酸循环,但UPR介导的代谢重组是否允许叶酸循环的维持还有待证明。 综上,作者通过多组学分析揭示了UPR过程中转录组、蛋白质组乃至细胞代谢的整体变化,定义了UPR调节子,并且发现了UPR能够通过增...
集群1用蓝线表示,集群2用红线表示 铜死亡调节子的甲基化分析 基因启动子区域的甲基化在很大程度上调节着基因的表达,而高甲基化一般会抑制基因的表达。然而,在一些特殊情况下,启动子区域的高甲基化可能会增强某基因的表达,如htert。为了探...
肺炎军团菌反应调节子leta对dota2cralf基因调节作用的的分析研究 ＡＲＦ ＢＳＡ ＤＥＰＣ ｄＮＴＰ ｄｏｔ ＥＤＴＡ ＥＭＢ ＥＰ ＧＥＦ ｈ ｌｃｍ ＬＡＭＰ．１ｌｅｔＡ ＬＬＡＰ ｍｌｎ ＭＯＩ ＯＤ ＰＢＳ ＰＣＲ ＰＡＧＥｒｐｍ ＲＥＲ Ａｂｂｒｅｖｉａｔｉｏｎｓ ＡＤＰｒｉｂｏｓｙｌａｔｉｏ...
本文将探讨光合作用调节因子与光能利用效率之间的关系,并对其进行分析。 光合作用调节因子是指能够调节光合作用速率的一系列因素,包括光强度、温度、二氧化碳浓度、水分等。这些因子可以影响光合作用的效率,从而影响植物的生长和生物量积累。研究光合作用调节因子与光能利用效率的关系,对于提高作物的产量和光能利用效率具有...
细胞分裂素反应调节子(RRs)是细胞分裂素信号转导通路上的重要组分,其中RR22是C型反应调节因子。基于星油藤基因组和转录组数据库,该文克隆了PvoRR22基因,并对其生物信息学以及不同组织部位和6-BA处理花序芽中的表达模式进行了分析。结果表明:(1)PvoRR22编码含170个氨基酸的蛋白。PvoRR22蛋白...
此外,SOX4是某些间充质标志物(即VIM和FN1)的直接上游调节因子,如基因调控网络分析所示(图1 B)。在WD喂养的ApoE−/− 小鼠主动脉根部和人动脉粥样硬化冠状动脉和肾动脉中,分别在斑块区和EC层观察到SOX4上调(图1 C、E)。这种上调伴随着小鼠主动脉和人动脉粥样硬化肾动脉分离的ECs中内皮标志物(即eNOS和...
1、RA-FLSs的分泌组分析 为了评估RA-FLSs的促炎分泌组,作者培养了从RA患者滑膜组织中分离的FLSs,这些患者未经治疗(对照组)或接受肿瘤坏死因子(TNF)α+白细胞介素(IL)-1β治疗,模拟RA关节的炎症状态(图1A)。在汇集培养上清后,作者将汇集的样品分成24个部分,并使用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)分析对单个部分进...