该研究开发了一种名为“深度视觉蛋白质组学”（Deep Visual Proteomics，DVP）的新方法。该方法结合了先进的显微技术、人工智能和超高灵敏度蛋白质组学来表征单个肿瘤细胞的特性，可以无偏倚地量化肿瘤细胞中的数千种蛋白质，以此揭示驱动肿瘤进化的机制以及肿瘤的全新治疗靶点。深度视觉蛋白质组学（DVP），是一种将人...
尽管基于成像和质谱的空间蛋白质组学方法取得了进展,但将图像与单细胞分辨率蛋白质丰度测量联系起来仍然是一个挑战。现在,由哥本哈根大学领导的一个国际研究小组开发了一种称为深度视觉蛋白质组学(DVP)的新方法,并已应用于癌细胞。研究人员认为,利用这项技术,可以有效地将显微镜下观察到的细胞生理特征与蛋白质的功能联...
1月14日,丹麦哥本哈根大学蛋白质研究中心、德国 Max Plank 生物化学研究所Matthias Mann团队在Molecular cell发表了空间蛋白质组学研究的resource文章。通过高度多路复用成像(highly multiplexed imaging)和深度视觉蛋白质组学(DVP) 方法揭示了肿瘤免疫微环境中的功能性肿瘤-免疫相互作用。 图1 文章截图 「提纲挈领...
Ronald Vale教授以及David Agard教授合作在Cell上发表了文章De novo protein identification in mammalian sperm using in situ cryoelectron tomography and AlphaFold2 docking,研究人员在小鼠精子细胞中建立了一个视觉蛋白质组学的工作流程。
近年来,基于成像和基于质谱的空间蛋白质组学方法取得了进步,但将图像与单细胞分辨率蛋白质丰度测量联系起来一直是一个挑战。 近日,哥本哈根大学领导的研究团队开发的了“深度视觉蛋白质组学(DVP)”,已应用于癌细胞。该文章以“Deep Visual Proteomics defines single-cell identity and heterogeneity”为题发表在Nature Bi...
近期研究“Deep Visual Proteomics defines single-cell identity and heterogeneity”发表在《Nature Biotechnology》杂志上,证明了深度视觉蛋白质组学技术首次应用于癌细胞的潜力。该研究将肿瘤的视觉特征与深度分析技术相结合,以可视化与周围健康细胞相邻的畸变细胞中的蛋白质特征。这将使研究人员对疾病有前所未有的认识,...
该研究运用深度视觉蛋白质组学(DVP)技术,对印戒细胞癌(SRCC)进行了深入探究,为理解 SRCC 的发病机制、寻找潜在治疗靶点以及制定个性化治疗策略提供了重要依据,在精准肿瘤学领域具有关键意义。 一、研究背景 SRCC 是一种罕见且恶性程度高的腺癌,可发生于多个器官,胃是最常见的原发部位,但也有在前列腺、乳腺、肺...
近期研究“Deep Visual Proteomics defines single-cell identity and heterogeneity”发表在《Nature Biotechnology》杂志上,证明了深度视觉蛋白质组学技术首次应用于癌细胞的潜力。该研究将肿瘤的视觉特征与深度分析技术相结合,以可视化与周围...
该研究开发了一种名为“深度视觉蛋白质组学” (Deep Visual Proteomics,DVP) 的新方法。 该方法结合了先进的显微技术、人工智能和超高灵敏度蛋白质组学来表征单个肿瘤细胞的特性,可以无偏倚地量化肿瘤细胞中的数千种蛋白质,以此揭示驱动肿瘤进化的机制以及肿瘤的全新治疗靶点。
本文描述了一种“差异视觉蛋白质组学”(DVP)方法,在蛋白质组学层面研究不同样本间蛋白质和蛋白质复合体的结构变化。细胞裂解后,用无损方式制备成单粒子电子显微镜的上机样品,扫描成像。图像中的单个蛋白质粒子被提取出来,排列,归类,用定量分析法找到阴、阳性对照样品间蛋白质粒子结构的差异。单细胞受到干扰后,可用该...