iNature 染色质修饰是决定基因组功能的基本表观遗传标记,但对重复元件和复杂基因组区域的修饰仍然具有挑战性。 2024年10月7日,北京大学汤富酬团队在Nature Methods(IF=36)在线发表题为“scNanoSeq-CUT&Tag: a single-cell long-read ...
决定癌细胞走向哪条路径的是它们的表观遗传状态。这在人类肿瘤细胞的实验中也得到了证实。这项研究的结果可能为新的诊断和治疗应用铺平道路。 扩散的肿瘤细胞在转移部位出现了两种行为:一些肿瘤细胞立即开始形成转移。另一些肿瘤离开血管,然后进入长时间的休眠。...
ChIPseq 的一个共同目标是表征全基因组转录因子结合位点或表观遗传状态。 转录因子结合位点和表观遗传事件的存在通常在其假定目标基因的背景下进一步分析,以表征转录因子和表观遗传事件的功能和/或生物学作用。 随着ENCODE 对转录因子结合位点或表观遗传状态的大规模映射的发布以及用于高通量测序的多重技术的出现,重复 ...
图1 细胞核受到挤压后,直接重编程效率显著升高 通过对细胞表观遗传状态的探索发现,细胞受到瞬时挤压后的24小时内,组蛋白H3K9和DNA的甲基化水平均显著性下降。同时,力学诱导的H3K9me3和5m-C下降与通过抑制剂联合处理细胞24小时后的下降水平基本一致。此外,通过与加州大学圣地亚哥分校(UCSD)王英晓教授合作,借助活细胞FRET...
ChIPseq 的一个共同目标是表征全基因组转录因子结合位点或表观遗传状态。 转录因子结合位点和表观遗传事件的存在通常在其假定目标基因的背景下进一步分析,以表征转录因子和表观遗传事件的功能和/或生物学作用。 随着ENCODE 对转录因子结合位点或表观遗传状态的大规模映射的发布以及用于高通量测序的多重技术的出现,重复...
DNA在细胞周期的S期被复制,其时间顺序称为复制时间(RT)程序。RT在真核生物生理过程中是一种保守的程序,受发育控制,并与许多重要的表观基因组特征相关。然而,没有直接的证据表明RT与表观遗传状态维持有关,主要原因是当前技术还不能操纵全基因组RT。 为了深入了解全基因组RT在塑造表观基因组中的作用,在该研究中,...
来自德国癌症研究中心(DKFZ)和海德堡大学的科学家在小鼠身上研究了扩散的肿瘤细胞在转移部位的行为:一些肿瘤细胞立即开始形成转移。另一些肿瘤离开血管,然后进入长时间的休眠。决定癌细胞走向哪条路径的是它们的表观遗传状态。这在人类肿瘤细胞的实验中也得到了证实。这项研究的结果可能为新的诊断和治疗应用铺平道路。
ChIPseq 的一个共同目标是表征全基因组转录因子结合位点或表观遗传状态。 转录因子结合位点和表观遗传事件的存在通常在其假定目标基因的背景下进一步分析,以表征转录因子和表观遗传事件的功能和/或生物学作用。 随着ENCODE 对转录因子结合位点或表观遗传状态的大规模映射的发布以及用于高通量测序的多重技术的出现,重复...
过去临床上无法检测胚胎的发育状况,只是检测了遗传因素,丢失了半壁江山。表观遗传信息是衡量发育的最直接指标,表观遗传信息可以反应胚胎的发育状态和孕妇生理状态是否正常。通过对表观遗传信息的检测可以改变临床上无法监控胚胎发育状态和孕妇生理、病理的困境,提升生殖健康水平,从而推动生殖医学的革新。
近日发表在《科学》杂志上的一项研究称,美国佛罗里达州立大学大卫·吉尔伯特博士带领的研究团队回答了一个60年未解的科学谜题:DNA的复制时序维持着人类细胞中全局的表观遗传状态。在过去60年里,科学家已经能够观察到遗传信息的复制方式和时间,并确定了“复制时序程序”的存在,该程序控制着DNA片段的复制时间和顺序,...