咱先简单说说分子动力学,这玩意儿就是研究分子体系的原子运动轨迹的,就好像在看一群超级小的“舞者”(原子们)在微观世界里蹦跶。 那蛙跳法呢,它是一种特殊的算法。为啥叫蛙跳法这么个有趣的名字呢🧐 想象一下青蛙跳荷叶的样子,一蹦一蹦的。在这个算法里,粒子的位置和速度的更新就有点像青蛙跳荷叶的节奏。
同时,蛙跳积分法也有细微处的处理差异,主要来自从速度Verlet法转到含速度因素项的加速度求解的妥协处理,Verlet方法适用于没有与速度直接相关的力学系统求解,尤其适用于那些势能函数只依赖于位置而与速度无关的势能系统(如分子动力学)。大多数情况下,水动力学问题,没法保证所求问题现在及以后与速度无关。 本文均求解...
本文基于蛙跳算法提出了蛙跳"居中"方案.这是一种新的统一方案,可以用来发展新的控温算法对正则系综高效地同时得到精确的位置边缘分布和精确的动量边缘分布.由于蛙跳算法是一种常用算法,在一些分子动力学模拟软件中常被默认采用,这一统一控温方案能为这些软件提供方便高效的新算法来对实际分子体系做经典(或量子)正则系综...
采用Tersoff势对晶态3C-SiC结构进行了NEV系综的分子动力学模拟,在合适的步数和步长下选用蛙跳法计算该体系的温度、径向分布函数和键角分布,模拟结果表明常温下3C-SiC晶体保持着长程有序闪锌矿结构。 2) Leapfrog 蛙跳 3) Leapfrogging “蛙跳” 4) leapfrog technique ...