RNA和蛋白质相互作用是指RNA分子与蛋白质分子之间的物理、化学或生物学相互作用。RNA可以通过与蛋白质相互作用来调控蛋白质的功能,而蛋白质也可以影响RNA的结构和稳定性。这种相互作用可以对细胞和生物体内的各种生物学过程产生重要影响,包括基因表达、蛋白质合成、细胞信号传导等。RNA和蛋白质相互作用在许多疾病的发生和...
1. RNA与蛋白质的互作方式 RNA与蛋白质之间的互作是基于它们之间的化学结构相互配对的。RNA分子具有多种不同的结构,其中最常见的是单股线性结构和双股线性结构。蛋白质是由氨基酸单元组成的长链,具有三级结构:一级结构是氨基酸序列,二级结构是α-螺旋或β-折叠,三级结构是蛋白质的整体立体构象。RNA与蛋白质之间的互...
RNA pull down是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的主要实验方法之一。使⽤体外转录法标记⽣物素RNA探针,然后与胞浆蛋⽩提取液孵育,形成RNA-蛋⽩质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从⽽与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过WB 实验检测特定的RNA 结合蛋⽩是否与RNA 相互...
这些相互作用是基于特定RNA结构或序列的RNA与RNA结合蛋白之间的短暂接触。事实上今天我们要介绍的文章在2021年就投稿到了bioRxiv上,这篇文章中德国海德堡大学Katharina Höfer和Andres Jäschke团队发现蛋白质和RNA也可以通过共价键紧密结合在一起,这一过程被称为“RNAylation”。2022年有两篇文章相继报道了RNAylatio...
RNA pull-down 作为研究 RNA 与蛋白互作的核心技术,已成为研究焦点,是近年来研究IncRNA、circRNA与蛋白质相互作用的主要手段。其以RNA为主角,研究其与蛋白的互作。 RNA pulldown的原理是使用体外转录与生物素标记RNA,然后与细胞或组织的提取液进行孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物与链霉亲和素磁珠结合,通过磁分...
专题(一)介绍转录因子与靶基因启动子、专题(二)介绍蛋白质与蛋白质的互作预测。 本次介绍蛋白质与RNA互作。先上应用实操总结(同专题一/二总结类似,看过可忽略直接进入实操正文): 优点:利用AlphaFold3预测蛋白与靶RNA互作,目前大概是生信预测类中最准确的方法。充分使用该工具,make it(互作机制研究) easier。建议结...
用WB-TPP进行验证已知的RNA-蛋白质互作关系。 图 本研究工作流 结果速递 一、SPROX和TPP分析 在本研究中,使用图1所示的实验工作流程,在存在和不存在三种RNA配体的情况下,对LNCaP细胞核裂解液中的蛋白质进行SPROX和TPP的系列实验。结果发现,在TPP中测定的蛋白质的70%以上可以在SPROX分析中测定,只有SPROX中测定的32...
蛋白质和RNA是具有紧密关系的生物分子,能够通过物理相互作用参与完成细胞的周期并调控细胞的生物学过程。如果干扰了它们的正常相互作用,将会导致细胞功能紊乱,影响植物的生长发育。因此,研究RNA与蛋白质的相互作用,对于理解细胞内分子调控机制和植物的生长发育机理具有重要意义。
以下是一些RNA与蛋白质互作调控的新范式: 1. 蛋白质-RNA复合物:蛋白质和RNA在细胞内形成复杂的复合物,这些复合物在基因表达、细胞代谢等过程中起着重要的调控作用。例如,一些蛋白质可以与mRNA结合,通过影响mRNA的稳定性、翻译效率等方式调控基因表达。 2. RNA结合蛋白:一些蛋白质可以与特定的RNA序列结合,形成RNA-...
一.RNA pull down 技术应用 1.癌症肿瘤相关调控机制研究 LncRNA发挥功能的方式很广,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种生物学过程的调控,主要包括基因组表观遗传修饰、调控转录翻译、发挥ceRNA、增强子RNA作用等,从而对细胞增值、分化、迁移、凋亡、免疫等发挥调控作用。