DNA-蛋白对接,临时录的,效果不算好,多包涵 https://wenmr.science.uu.nl/, 视频播放量 3971、弹幕量 2、点赞数 53、投硬币枚数 22、收藏人数 157、转发人数 28, 视频作者 不聪明的老夫子, 作者简介 ,相关视频:Pymol-分子对接可视化分析(上)-傻瓜式教程,快速蛋白蛋白对
三款软件其实作为普通使用者,都很傻瓜式操作,大致都是四步:准备对接的小分子配体,准备对接的受体蛋白,圈出蛋白上的活性位点,把小分子配体对接上去。 Discovery Studio:是视频课里主要学习的软件,能看蛋白上的共结晶化合物与蛋白的作用方式,对接之后配体和蛋白的3D作用方式以及2D作用方式,如果是DNA和小分子配体对接可...
1. 📋 准备阶段:首先,你需要准备好蛋白质的序列以及DNA/RNA或pdb文件。小分子可以通过Chemdraw或Discovery Studio Client进行文件构建。 🔧 对接过程:对接运算可以通过alphafold3、Hdock或HADDock进行。 📊 结果分析:从对接结果中选出优势复合体,然后使用PDBePISA、PILP或ligplus进行互作氨基酸-碱基或碱基-化学基团...
采用大分子对接程序DOT对20个具有代表性的蛋白质-DNA体系进行对接,对对接结果就各打分项与体系中的带电性问题和构象变化问题之间的具体关系进行分析.结果表明,采用DOT对大部分蛋白质-DNA体系都找到了精确度较高的对接结果:范德华能和静电能对DOT组合能的贡献反映了蛋白质-DNA体系的天然特性;对接面上允许的碰撞原子...
不识别DNA序列(蛋白质做为受体,DNA做为配体),是需要有其他的设置么?都说可以做蛋白质-DNA的对接...
请问哪位知道什么软件能实现蛋白质与DNA的对接呢?不胜感激。
哔哩哔哩很多教程和安装包。就是安装失败率有点高,我安装十多次只有一次成功了,安装后对接成功了还要...
除了可以用ZDOCK来做蛋白质-蛋白质分子对接,还有什么在线网站或者是软件可以做蛋白质和DNA、蛋白质和蛋白...
除了可以用ZDOCK来做蛋白质-蛋白质分子对接,还有什么在线网站或者是软件可以做蛋白质和DNA、蛋白质和蛋白...
相互作用研究对筛选并设计高效兽药具有指导作用.本文采用多种光谱法及分子对接法研究了几种抗微生物兽药与蛋白及DNA的作用机制.采用光谱法和分子对接研究了磺胺氯吡嗪钠/马波沙星和牛血清白蛋白(BSA)/人血清白蛋白(HSA)的相互作用.结果表明,两种药物均静态猝灭BSA/HSA荧光且伴随着非辐射能量转移.通过计算获得结合常数...