蛋白质结构同源模建(又称同源模拟、同源建模)的理论基础是蛋白质的三级结构比蛋白质的一级结构更为保守。 2. 折叠识别 基本原理:从蛋白质结构数据库中识别与待测序列具有相似折叠类型,进而实现对待测序列的空间结构预测。 自然界中蛋白质折叠类型的...
即使两个蛋白质序列差异较大,它们可能具有相似的三维结构和功能。结构比较可以识别这种情况,从而揭示保守的结构功能关系,并帮助识别可能具有相似功能但序列差异大的蛋白质。所以我们时常通过蛋白质3D结构比较:进行功能预测、药物设计,解释蛋白质相互作用。 前面我们介绍了pymol进行蛋白质3D结构的比对:pymol-蛋白质3D结构...
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