蛋白质组学研究中常用的网站和数据库 一、蛋白质数据库 1.UniProt (The Universal Protein Resource) 网址: http://www.uniprot.org/ http://www.ebi.ac.uk/uniprot/简介:由EBI(欧洲生物信息研究所)、PIR(蛋白信息资源)和SIB(… BOSTER 【资料】蛋白质预测在线分析常用软件
⑦STRING：STRING是一个蛋白质互作关系数据库，整合了多种数据源的蛋白质互作信息，包括实验验证的互作、计算预测的互作和文献报道的互作。它提供了蛋白质互作网络的可视化和分析工具，用于研究蛋白质相互作用网络和功能模块。STRING: https://string-db.org/ ⑧InterPro：InterPro是一个蛋白质家族和结构域注释数据库，...
http://pfam.xfam.org/ 蛋白质三级结构预测 1. 同源建模(SWISS-MODEL) 蛋白质结构同源模建(又称同源模拟、同源建模)的理论基础是蛋白质的三级结构比蛋白质的一级结构更为保守。 2. 折叠识别 基本原理:从蛋白质结构数据库中识别与待测序列具有相...
一、蛋白质数据库 1.UniProt (The Universal Protein Resource) 网址:uniprot.org/ ebi.ac.uk/uniprot/ 简介:由EBI(欧洲生物信息研究所)、PIR(蛋白信息资源)和SIB(瑞士生物信息研究所)合作建立而成,提供详细的蛋白质序列、功能信息,如蛋白质功能描述、结构域结构、转录后修饰、修饰位点、变异度、二级结构、三级...
人类蛋白质图谱网站 网站(https://www.proteinatlas.org/)由十个独立的部分组成,每个部分侧重于人类蛋白质全基因组分析的一个特定方面: 1、组织部分,显示蛋白质在人体所有主要组织和器官中的分布; 2、大脑部分,探索哺乳动物大脑各个区域...
1 蛋白质序列的检索 1.1 从 NCBI 检索蛋白质序列 http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Protein1.2 利用 SRS 系统从 EMBL 检索蛋白质序列 http://srs.ebi.ac.uk/2 蛋白质序列的基本性质分析 2.1 …
某个基因蛋白质Domain Analysis结构域,Protein-Protein Interactions蛋白质相互作用,GO Enrichment Analysis富集分析,共表达分析等等 一、寻找一个蛋白质BCAR2,我们在ncbi网站中找到相关的某个基因的protein进入到网址中,找到相关的蛋白质的序列信息fasta https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/AAB07223.1?report=fasta二...
一、蛋白质数据库 1.UniProt (The Universal Protein Resource) 网址: http://www.uniprot.org/ http://www.ebi.ac.uk/uniprot/简介:由EBI(欧洲生物信息研究所)、PIR(蛋白信息资源)和SIB(… BOSTER 值得收藏——10个蛋白结构分析预测和相关信号转导网站 科研笔记发表于科研资源分... 实用蛋白质谱分析数据库...
尤其是Swiss-prot 子数据库,库中蛋白质信息都是手工核对过的 ,非冗余, 有详细注释信息的蛋白数据。 02.Proteinatlas 网址:https://www.proteinatlas.org 数据: The Human Protein Atlas(人类蛋白质图谱数据库) 基于蛋白组学、转录组学以及系统生物学数据,可以...
今天,小编给大家介绍一个很棒的蛋白质结构网站PDB,网址为rcsb.org/ (图片截取自PDB网站,仅供学习交流,非盈利) 我们可以在搜索框中输入感兴趣的蛋白名称,这里小编就以最常见的Hemoglobin(血红蛋白)为例吧。 (图片截取自PDB网站,仅供学习交流,非盈利) 点击GO,我们得到如下结果 (图片截取自PDB网站,仅供学习交流,非...