PROSITE是一个蛋白质结构域和模体数据库,用于识别蛋白质序列中的结构域和模体。它基于序列模式和保守模体进行蛋白质序列的注释和功能预测。 15 BioGRID数据库 ☑️网址:thebiogrid.org/ BioGRID是一个生物网格数据库,收集了蛋白质相互作用的实验验证数据。它提供了蛋白质相互作用网络的数据和分析工具,用于研究蛋白...
实际上，国内的学术界和产业界也在蛋白质结构预测领域紧追国际步伐。澎湃新闻（www.thepaper.cn）记者获悉，12月8日，北京深势科技有限公司（下称“深势科技”）宣布推出蛋白质结构预测工具 Uni-Fold，这是蛋白质结构研究领域首款完全开源并成功复现大规模训练的工具。据介绍，在相同的测试条件下，Uni-Fold 的预测...
诺贝尔奖官方表示，2024年诺贝尔化学奖的主题是蛋白质——生命中巧妙的化学工具。大卫·贝克成功完成了几乎不可能的任务，构建了大量全新的蛋白质。德米斯·哈萨比斯和约翰·朱姆珀开发了一种人工智能模型，解决了一个50年来的难题：预测蛋白质的复杂结构。这些发现具有巨大的潜力。生命的多样性证明了蛋白质作为化学工具...
该研究开发了一种名为HelixFold-Single的端到端的蛋白质结构预测方法,该方法结合了大规模蛋白质语言模型(PLM)和AlphaFold2优越的几何学习能力,不依赖多序列比对(MSA),仅从初级结构(氨基酸序列)预测原子三维坐标,从而实现对蛋白质结构的准确预测。此外,HelixFold-Single比目前基于MSA的主流蛋白质结构预测工具(AlphaFold2...
实际上,国内的学术界和产业界也在蛋白质结构预测领域紧追国际步伐。澎湃新闻(www.thepaper.cn)记者获悉,12月8日,北京深势科技有限公司(下称“深势科技”)宣布推出蛋白质结构预测工具 Uni-Fold,这是蛋白质结构研究领域首款完全开源并成功复现大规模训练的工具。
实际上,国内的学术界和产业界也在蛋白质结构预测领域紧追国际步伐。澎湃新闻(www.thepaper.cn)记者获悉,12月8日,北京深势科技有限公司(下称“深势科技”)宣布推出蛋白质结构预测工具 Uni-Fold,这是蛋白质结构研究领域首款完全开源并成功复现大规模训练的工具。
现在，西雅图华盛顿大学医学院蛋白质设计研究所的研究人员，研发出一款新的深度学习工具 RoseTTAFold，不仅拥有媲美 AlphaFold2 的蛋白质结构预测超高准确度，而且更快、所需计算机处理能力更低，更重要的是，RoseTTAFold 完全免费！相关论文发表在最新一期的 Science 杂志上。AlphaFold2：声名大噪的 “前浪”蛋白质是一切...
蛋白质结构预测是生物信息学领域的一个重要研究方向,其中AlphaFold和RoseTTAFold是两种常用的蛋白质结构预测工具。为了在本地环境中使用这些工具,我们首先需要创建一个conda环境,然后在这个环境中安装所需的软件包和工具。下面是具体的步骤:第一步:安装Miniconda或Anaconda如果还没有安装Miniconda或Anaconda,请先下载并安装。
近日,昇思MindSpore【1】团队与昌平实验室、北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)和化学与分子工程学院、深圳湾实验室高毅勤教授课题组联合推出基于AlphaFold2算法的蛋白质结构预测推理工具。该工具首次提供了基于昇腾AI基础软硬件平台的解决方案,并且端到端性能优于原版AlphaFold2 2-3倍。相关模型代码将依托于华为全场景...
实际上,国内的学术界和产业界也在蛋白质结构预测领域紧追国际步伐。澎湃新闻(www.thepaper.cn)记者获悉,12月8日,北京深势科技有限公司(下称“深势科技”)宣布推出蛋白质结构预测工具 Uni-Fold,这是蛋白质结构研究领域首款完全开源并成功复现大规模训练的工具。