蛋白质组学对药物发现做出了重要贡献,从靶点去卷积到作用机制(MoA)的阐明和药物反应生物标志物的鉴定。本文介绍了decryptE,这是一种蛋白质组范围的方法,可以测量药物诱导的蛋白质表达变化的全剂量反应特征,这些变化为细胞药物MoA提供了信息。针对8000种蛋白质对144种临床药物和研究化合物进行了检测,得出了100多万条剂量...
CPTAC数据库包含基因组测序数据与蛋白组学数据。其中基因组数据包含总计1300+不同类型肿瘤病人的WGS、WES和RNA-seq数据,可通过GDC Data Portal访问。 蛋白组数据可通过PDC访问,CPTAC数据库用到的蛋白质定量技术主要是基于质谱的检测技术,包括ITRAQ和TMT。 收集的信息如下: 此外,CPTAC数据库还提供了生物样品的元数据和临...
关于数据库的使用方法,首先可以通过网站访问(cptac-data-portal.georgetown.edu...)来获取数据,通过搜索工具输入感兴趣的癌症类型、蛋白质或基因名称,即可得到转录组和蛋白质组数据、元数据和临床数据。以结直肠癌为例,进入后会看到多种筛选类型,右侧分别展示了样本介绍和数据文件描述。数据文件包括Stu...
区别于线下课堂教授,网课具有方式多样,灵活便捷等优点,越来越多的学生群体和育儿父母的开始使用 【TCGA蛋白质数据库挖掘视频(TCPA数据库/RPPA蛋白质组学)】主要学习【TCGA蛋白质数据库挖掘】方面的基础理论和基本知识,培养【TCPA数据库/RPPA蛋白质组学】做出分类鉴别的能力。特意为大家整理了“TCGA蛋白质数据库挖掘视频...
其次,从选题上,大方向都已经没有可挖掘的方向,那就在细分领域深入挖掘。可以结合你和老师的研究领域...